New York Timesを読んでいたら面白い記事というかエッセイを見つけました。
アメリカの元財務長官でハーバード大学の学長もしたサマーズ氏の”What You (Really) Need to Know“というタイトルです。
時代が変わっているのだから教育システムも変わる必要があるということを主張した文章です。
このエッセーを巡って紙上debate(“English Is Global, So Why Learn Arabic?“)も開催されています。

主張が箇条書きにされているのですが少し引用してみます。(ぼくが一部を太字にしました）

1. Education will be more about how to process and use information and less about imparting it. This is a consequence of both the proliferation of knowledge — and how much of it any student can truly absorb — and changes in technology.
2. An inevitable consequence of the knowledge explosion is that tasks will be carried out with far more collaboration. As just one example, the fraction of economics papers that are co-authored has more than doubled in the 30 years that I have been an economist.
3. New technologies will profoundly alter the way knowledge is conveyed. Electronic readers allow textbooks to be constantly revised, and to incorporate audio and visual effects.
4. As articulated by the Nobel Prize-winner Daniel Kahneman in “Thinking, Fast and Slow,” we understand the processes of human thought much better than we once did. We are not rational calculating machines but collections of modules, each programmed to be adroit at a particular set of tasks.
5. The world is much more open, and events abroad affect the lives of Americans more than ever before. This makes it essential that the educational experience breed cosmopolitanism — that students have international experiences, and classes in the social sciences draw on examples from around the world.
6. Courses of study will place much more emphasis on the analysis of data. Gen. George Marshall famously told a Princeton commencement audience that it was impossible to think seriously about the future of postwar Europe without giving close attention to Thucydides on the Peloponnesian War.

まあこれってよく言われることですよね。ちきりん氏の「自分のアタマで考えよう
」でも同じような主張はされています。でもサマーズ氏がこのようにまとめると権威あります。

このエッセーでサマーズ氏は

English’s emergence as the global language, along with the rapid progress in machine translation and the fragmentation of languages spoken around the world, make it less clear that the substantial investment necessary to speak a foreign tongue is universally worthwhile. While there is no gainsaying the insights that come from mastering a language, it will over time become less essential in doing business in Asia, treating patients in Africa or helping resolve conflicts in the Middle East.

と述べているのですがこの部分について紙上debateが行われています。

たぶん近い将来にに日本語をしゃべったり書いたりするそばから英語やフランス語に翻訳されていくシステムができると思います。
留学をしない，しなくてもよい理由をいくら並べてみても栓がありません。当たり前ですが英会話がうまくなるために留学するわけではありません。より広い視野を獲得するために留学するのですから。

Nature Cell Biologyに
The LIMD1 protein bridges an association between the prolyl hydroxylases and VHL to repress HIF-1 activity
Nature Cell Biology (2012) doi:10.1038/ncb2424
という論文が出ていました。これは面白いです。しかしこの論文はぼくらの2001年の論文の解析の途中でもある程度予想されていたような事象だと思います(参照-Web of Scienceの統計では507回引用されたようです。）。

今年も「キアドラ」が届きました。

医学界新聞を読んでいたら”Experimental Design for Biologists“の邦訳「バイオ研究のための実験デザイン -あなたの実験を成功に導くために」が出ているのを知りました。日本語は読んでいませんがよい本だと思います。

関連するエントリー:

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• 麻酔法なども特許になるのか？-ならない？
• あと一廻り早く生まれていたら…

録画してあったNHKのドキュメント「日本人は何を考えてきたのか」をまとめて見ました。
田中正造と南方熊楠の二人は「坂の上の雲」の対極にいるような人達だという中沢新一さんのコメントに同意。
この番組を見ていて思い出して「社会は絶えず夢を見ている」を再読しました。

この本のテーマというかキーワードの一つは「第三者の審級」です。
特に第三講ーこの本は大澤氏の講義録というような体裁を採っていますー「リスク社会の（二種類の）恐怖」はぼくにとっては重要な論考が展開されている章です。
これは患者と医療提供者との関係にも拡張して考える事ができると思ってそこら辺を考察してみようとおもっていたのですがネットを調べるとすでに大澤氏本人による考察が存在しました。あまりにも見事な論考なので紹介します。

医療についての論考の部分の冒頭を引用してしてみます。

リスク社会においては、第三者の審級が、二重の意味で――つまり本質と現実存在の両方に関して――撤退している。しかし、人はこの事実を否認しようとしている。現代社会には、「第三者の審級の二重の撤退」を示す徴候が、至るところに――とりわけ科学にかかわる領域に――見出される。

そうした徴候の一つとして、医療の分野における「インフォームド・コンセント」の流行を挙げることができるだろう。インフォームド・コンセントとは、医者が患者に手術などの医療措置について、その効能や危険性についてよく説明した上で、患者から同意を得ることである。インフォームド・コンセントは、どのような治療を採用するかを、最終的には患者自身に選ばせることだと解釈することができる。これ自体は、たいへん結構なやり方だ。

しかし、どうして、ことあらためて、こうしたことが推進されなくてはならなくなったのかを考えてみれば、われわれは、ただちに、これが第三者の審級の不在に対する対抗手段であることに気が付く。

現代医療を支配しているのは統計・確率の考え方だと思っています。evidence-based medicineの本質は統計・確率でしょう。臨床の医療行為はある意味では「シュレーディンガーの猫」が入っている箱を実際に開けるようなものです。このような現代医学は，患者とまたそれを提供している医師にとって「ほんとうの第三者の審級」として絶対的に君臨することはありません。どんな名医であっても原理的には「ほんとうの第三者の審級」の視点を提供できないのです。
「人は永遠に生きることはできない」という事実はすべての人間が共有している考えだとぼくは思いますが，患者はもちろん医者の中にも「人は永遠に生きることができる」という妄想というか言葉が悪ければ根拠のない希望を抱くものがあることが現代医療の抱えている根本問題の一つだとぼくは考えています。しかし同時にそのような希望を持つことは間違ってはいません。だからこそ現代医療の抱える問題が単純な処方では解くことのできないアポリアなのでしょう。
また医療はリアルな臨床の行為で有りその問題点をある視点から考えたと言っても実際に存在する問題が解ける訳ではありません。このような事情を無視した「安全管理室」的な発想が医療現場を蹂躙しつつあることに憤りを感じますー今日はこれが言いたいだけだったのですー。

ヘーゲルはナポレオンがイェーナに入場する姿をみて「世界精神が馬に乗って通る」と言ったそうですが，確かにこのような時代にはある種の「独裁者」が人心をつかむ局面があると思います。よいか悪いかはぼくは知りません。

2-hydroxyglutarate detection by magnetic resonance spectroscopy in IDH-mutated patients with gliomas

Nature Medicine (2012) doi:10.1038/nm.2682

これすごいですよ。

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御大ブログエントリー読みました。
ぼくは結構苦労した方です。バカですから。でもその当時，自分では”つらい”とは思っていませんでした。しかし，家内は頭の悪いのと一緒になって苦労したといいますので苦労したのだと思います，客観的には。

医局にあった先週の朝日新聞を読んでいたら「容疑者Xの献身」が米国のエドガー賞の候補に挙がっているという記事を見つけました(参照）。ということは英訳されているということなのでamazon.comで調べると果たしてKindle版で$9.99だったので買って読んでみました。
これはうまく訳されていると思います。英訳を読んでも日本語で読んだのと同じような感動を得ることが十分できると思います。
宮部みゆき氏の「火車」も英訳されていてすばらしい翻訳だと思います。アメリカにいたときに徹夜して手に汗握って読んだ記憶があります。でもこっちにはKindle版はありません。

全国的に大雪だそうですが京都は平場の降雪はほとんどありませんでした。
しかし確かに寒いです。

注文していた「理系のためのクラウド知的生産術 (ブルーバックス)」が届いたので読んでみました。
一種のハック本です。
ざっと読み進めていきますと第五章は「クラウド上で論文を書く」と題された”Google Documents”を用いた論文執筆の提案です。
以前試みたことがあったのですが挫折しました。同時の”Google document”の機能がすこし貧弱でそれで断念したような記憶があります。この章の10番目は「つり革に房下がりながら論文執筆」ということで電車の中でも論文執筆ができるよということですが，これはぼくにはネタとしか思えません。
第六章は「時間も空間も超えるコラボレーション術」で”Skype”や”Slideshare”を用いた手法が紹介されています。これは役に立つと思います。最近実際に体験してびっくりしたのは”GoToMeeting”というサービスです。数人でのテレカンファレンスを支援するサービスですごくよくワークします。アメリカと日本でもほとんど違和感はありません。”ミーティング”のホストの操作によりある人のPCのデスクトップをshareしてPowerPointのプレゼンテーションも臨場感たっぷりに視聴できます。全員がサービスに優良で加入する必要はなく誰か一人が入っていればその人の招待という形でミーティングに参加できます。これは一回経験すると感動します。
“Remember The Milk“を以前は利用していたのですがここ一年くらい使うのをやめていました。”Pro”アカウントの$25をケチったのですがこの本を読んだのがきかっけで$25払って使い始めました。結局一番使いやすいような気がします。

情報の呼吸法 (アイデアインク)も読んでみました。
これはTwitterの解説本やハック本ではありません。
本の中身も表紙と同じ色で手にすると一瞬ギョッとしますが気軽に読むことができて読み終わるとtwitterも今までとは違う活用をしてみようと思うようになります。それで何かヒントがつかめれば940円は安い！，ということになります。

論文です。
Endothelial Cell HIF-1α and HIF-2α Differentially Regulate Metastatic Success.

Cancer Cell. 2012 Jan 17;21(1):52-65.

ちょっと話がうますぎるなと思いましたが十分問題提起のきっかけになる論文だと思います。

関連するエントリー:

• iPhone本”iPhone情報整理術”
• Kindleが
• Remember The Milk for Gmail
• omniFocus
• 大学院生に身につけてほしいこと

1. 大学教員（研究者）になる＝応募者の中で絶対に1番になることであり、絶望的なぐらい困難で覚悟の要る挑戦
2. 大学教員公募を勝ち抜くのは大変だし、ノウハウも要る
3. 就活競争激化によって競争原理が働き、近い将来日本のアカデミアは優秀な研究者だけが残るはず
4. （3.への反論）むしろ過当競争激化によって優秀な人材のアカデミア敬遠が進み、明るい未来は期待できない
5. （1.の補足）大学教員公募には様々な表面には出て来ない選考基準がある上に、「大学教員になるためには大学教員であるという経験が必要」という実務経験重視主義があるため、一番最初に大学教員になる際のハードルが最も高い

一般的なポスドク問題とこのような状況はすこし原因も対処も異なるのでは無いかという気もしますが当事者にとっては厳しさは同じなのでしょう。
京大でもいわゆるテニュアトラックの教員募集には驚くほどの応募があるのだそうです。そう思うと皆さんすごく賢そうですね確かに。

こういった議論を目にするといつも思うのは所変われば事情も大きく変わるのだなということです。
医学部の臨床系の講座では基本的にはこのような問題は生じません。
たとえば卒後4・5年目で博士号はおろか当該科の専門医資格も無くとも「助教」になることが簡単にできます。
そもそも博士号でさえ週に数日”研究”することで取得できる場合もあるようです。
「助教」は「助教」ですから研究費の申請も可能であり，ある程度の金額の研究補助を受けることができれば自分の身の丈にあった研究生活を続けることは十分可能です。学術振興会の研究費の若手区分であればpublicationなど無くとも採択される可能性は十分あり消耗品の費用を賄うことができれば総合大学であれば必要な測定機器は学内のどこかにあるはずなので頭を下げれば使わせてもらえることがほとんどでしょう。
ぼくらの所属していた講座では大学院を終わったくらいでないと当時の「助手」-文部教官でしたーには採用してもらえませんでしたが，大学によりそのような制約が無いのは確実です。専門医資格も無く「助教」になるのですからそういった制約は現在でも無いのだと思います。
現在でもぼくの職場では「助教」のポストには公募が行われることがあり選考委員会が開かれますが競争率が100倍などということはありません。多くの場合准教授の選考でも競争率は2倍です。

ぼくの場合，大学院の終わりくらいから他人のアイデアで実験をしたことはほとんどありません。例外はGLS研に滞在した期間の一部の研究だけです。
当然研究費は自分で取るしかありません。麻酔科の助手に奇特な誰かさんが大きな予算をつけてくれるわけではありません。日本学術振興会の研究費を取って研究を続けるしかありません。どこかのエライ先生方が審査をしてくれるそうですが自分の感覚では種目を限れば結構当たります。年に1千万程度の資金をコンスタントに集めることができれば3−4人の大学院生と研究を続ける事は十分可能です。もちろんそんな小さなお金ではポスドクなどを雇うことはできません。というわけで今まで10人の大学院生に学位を取得してもらいました。
研究で一番大切なのは質のよい「大脳皮質」であり，たぶんぼくの頭がすばらしければこのような環境でもすばらしい論文を出し続けることは可能なのでしょうが，なかなかそううまくはいきません。
それでもぶらぶらと道草を喰いながら歩いていれば500回くらいの引用回数を記録する論文を出すことは可能です。
当該研究分野の研究者なら当然全員その論文を読んでいるに違いないという論文をぼくはごく控えめに少なく見積もって4編は出したと思っています。
それくらいで満足する以外に術はありません。

ぼくにとっては今までの研究人生はこれでなかなか楽しいものでした。

全員がNature, Cell, Scienceに論文を出すことはできないし出す必要もないのです。

というわけでどこでもいいので臨床講座の助教になってみるのはどうでしょうか？
なんていうとバカにするなとかいわれそうですけど世の中の制度に不備がある状況でしかしあくまで現行制度で研究生活を継続するためには戦術を考える必要はあると思います。まず自分の研究室をはじめる，それが先決です。

御大がこんなtweetをしておられました。
御大レベルでもとおもいびっくりしました。ぼくなどもちろん誰もカレンダーなど持って来てくれません。
それでやはり御大です。tweetすればちゃんと届けてくれる人はいるようです(参照）。

関連するエントリー:

• ガンとハイポキシア研究会は1/29・1/30
• ”でも私を信じてくれたなら　すべてが本物になる”
• 今年最高と言い切ってしまいます
• 朝から，結構むかつきました
• 実物はまじでカワイイらしいよ

思いついて｢家政婦のミタ｣の動画を探して観ました。ついに最終回もクリアです。ネットってすごいですね。第一回から最終回までありました。
Simplyに家族を大事にしないといけないと思わされました。テレビ番組なのですからあれで十分満足です。
“うらら”役の相武紗季が妙にフけているなと思ったらもう26歳なんですね。今後どんな展開をしていくのでしょうか。そっちが心配になりました。

業務命令以外は話しかけないで下さい。／どうしてもと言うのならお暇を頂きます。

これらのフレーズはどんどんと使っていこうと思いました。

New York Timesを読んでいたらEric Lander氏が取り上げられていました (Profiles In Science | Eric Lander Power in Numbers)。

Collins氏とVenter氏の間に隠れていますがHuman Genome Project (当時のクリントン大統領から”We are here to celebrate the completion of the first survey of the entire human genome. Without a doubt, this is the most important, most wondrous map ever produced by humankind”と評されたprojectです)の立役者の一人だと思います(参照)。

そのLander氏の生い立ちから説き起こしたなかなか興味深い評伝だと思います。Landerって生まれながらの天才というか秀才だったのですね。

Even before the Human Genome Project ended, Dr. Lander was thinking of how to keep what he saw as a wonderful collaboration among scientists going. There were, by his count, about 65 collaborations among young scientists in Cambridge and Boston, all outside the usual channels.
“Something magical had happened,” Dr. Lander said. “People were coming together and taking on really bold problems.”
It may have had something to do with Dr. Lander’s personality. Gus Cervini, an administrator at Brigham and Women’s Hospital in Boston who worked for him for four years, used to call him “the sun.”
“He has this amazing influence or power on people,” Mr. Cervini said. “He had this ability to get people to really think big.
“When the sun shines on you, you feel like you can do anything.”

というように手放しでほめまくられています。”太陽”ってすごい表現ですよね。

この休みに
｢この胸に深々と突き刺さる矢を抜け｣を読みました。読むとわかりますが普通の小説とはだいぶ趣が異なります。｢救い｣がない小説でもあります。何で読んじゃったのかと思いますが読み始めたら一気に４時間くらいで読み切ってしまいました。

この小説で引用されていた累犯障害者も読みました。これはまたまた救いのない話です。
不可能性の時代 (岩波新書)も再読したのですが年末年始は結構暗い気持ちになりました。

家で黙っていたら家内になんで何もしゃべらないのかと云われました。いつもしゃべらないのですが文句は云うのです。それも云わないので気味悪がられたのです。

“Science”の”Areas to Watch”というエッセイで2012年への展望が紹介されています。

• The Higgs boson
• Faster-than-light neutrinos
• Stem-cell metabolism
• Treating intellectual disability
• Curiosity to Mars

の5項目です。
Stem-cell metabolismでは

The way stem cells use energy and intermediate metabolites seems to help determine when they differentiate and what kinds of cells they become. In 2012, look for researchers to use large-scale studies of stem cell metabolism to gain new insights into how stem cells regulate themselves in the body—and how scientists might tweak the process in the lab or in patients.

昨年から｢がん｣でも｢幹細胞｣でもなんでもかんでも代謝ですね。関連するエントリー:

• 夏のツイ呑み会
• ハイポキシア生物学の2010年を振り返って
• 「雲洞庵の土踏んだか」
• ”人格的な欠陥を抱えた人間”にも一見無駄だと思える行為をする権利がある
• E.R. confusion

昨年同様まず統計から。
pubmedを（HIF[TIAB] and 2011[DP]）で検索すると1291件と出ました。昨年が1136件でしたのでほぼ同じ勢いです。毎日3つ以上HIF関連の論文が出版されているのです。

また(hypoxia[TIAB] and 2011[DP])だと4652件。昨年が4167件でしたのでこちらはたぶん有意に増加ですね。

ちなみに(iPS[TIAB] and 2011[DP])は 598件ですし，(anesthesia[TIAB] or anesthesiology [TIAB]) and 2011[DP] は4679件です。

酸素がさまざまな生命現象に関わっているということがあるので酸素分圧感知機構-HIFの経路も様々な生命現象に関わっています。すでに2000年にはGLSによるこんな総説が出ているほどです。
そして今年はとうとうNEJMに
Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease

N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.

が掲載されました。快挙ですね。

昨年

来年はHIFの活性化機構を原理として利用する方法でない細胞内酸素分圧のimagingが可能になってくると思います。今年発表されたいくつかのprobeを使ったよい研究が出て来るのが楽しみです。

と書きました。

理想のプローブは今年も現れませんでしたが
Hypoxia-sensitive fluorescent probes for in vivo real-time fluorescence imaging of acute ischemia.

J Am Chem Soc. 2010 Nov 17;132(45):15846-8

で記述されているローブには興味を引かれました。
研究会でも直接お話しを伺うことができました。
腎臓は酸素消費量が多くHRE依存的な遺伝子発現が通常酸素分圧下で生きているマウスでも観察されます。このような領域を低酸素領域と呼ぶかどうかは別としてこの程度のHIFの活性化をある程度の線形性をもって表現できる低酸素プローブが開発されてリアルイメージングに応用できるとよいと思います。
ぼくのほしいプローブはこんなプローブです。よろしくお願いします。できたらはじめに使わせてください。

その他の低酸素プローブにはあまり興味をもてませんでした。

Natureに植物の低酸素応答に関する論文が二つback-to-backで出ていました。
Oxygen sensing in plants is mediated by an N-end rule pathway for protein destabilization

Nature. 2011 Oct 23;479(7373):419-22. doi: 10.1038/nature10536.

と
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants.

Nature. 2011 Oct 23;479(7373):415-8. doi: 10.1038/nature10534.

たぶんぼくは完全に理解はできないと思いましたがネタとしては知っておくのがよいと思ったので読んでみました。

TRPA1 underlies a sensing mechanism for O2.

Nat Chem Biol. 2011 Aug 28;7(10):701-11. doi: 10.1038/nchembio.640.

もよい論文です。TRP channelがサブタイプ特異的に環境の酸素分圧の上がり下がりをセンスしていてるということを示した論文です。この論文も著者の高橋さんにぼくらの勉強会でセミナーをしていただきいろんな話を聞けました。来年度やりたい人がいれば挑戦していただきたいとぼくは思っています。
今年も医科研の坂本先生のMint3ネタで論文が出ています。
Deletion of the Mint3/APBA3 gene in mice abrogates macrophage functions and increases resistance to lipopolysaccaride-induced septic shock.

J Biol Chem. 2011 Sep 16;286(37):32542-51.

Pyruvate kinase M2 is a PHD3-stimulated coactivator for hypoxia-inducible factor 1.

Cell. 2011 May 27;145(5):732-44.

MCM proteins are negative regulators of hypoxia-inducible factor 1.

Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):700-12.

Hypoxia. Cross talk between oxygen sensing and the cell cycle machinery.

Am J Physiol Cell Physiol. 2011 Sep;301(3):C550-2.

これらもよかったです。
GLS件はやはり一歩進んでいる感じがします。
以前といってもぼくが大学生の頃NHKのFM放送に作家の五木寛之が出演していて自分の立ち位置をトラック競技になぞらえて話していたことがあり今でも記憶に残っています。つまり自分は他のランナーの集団から少し先を走っているのであるがその少しはそのように見えるだけであって実はトラック一周先行した上での少し先なのだと。生命科学の世界でもそのような研究室ってありますよね。
そうそう
Control of T(H)17/T(reg) balance by hypoxia-inducible factor 1.

Cell. 2011 Sep 2;146(5):772-84.

これも印象的でした。先行論文があったのですがこっちはCellということで勢いの違いはあるのだと思います。

A HIF-1 target, ATIA, protects cells from apoptosis by modulating the mitochondrial thioredoxin,TRX2.

Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):597-609.

thioredoxin関連はいつも注目しています。

また腎臓のEPO産生細胞についての京大の柳田さん-御大ではありません。念のため。でも御大みたいなものかも-の研究室の
Dysfunction of fibroblasts of extrarenal origin underlies renal fibrosis and renal anemia in mice.

J Clin Invest. 2011 Oct 3;121(10):3981-90. doi: 10.1172/JCI57301

と
東北大学の山本先生のお部屋の鈴木さん方の
Isolation and characterization of renal erythropoietin-producing cells from genetically produced anemia mice.

PLoS One. 2011;6(10):e25839.

はすごいと思いました。

論文を読むとPapersで整理して☆をつけます。
最高が☆☆☆☆☆なわけですが，今日整理していて

Hypoxia increases transepithelial electrical conductance and reduces occludin at the plasmamembrane in alveolar epithelial cells via PKC-ζ and PP2A pathway.

Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2011 Apr;300(4):L569-78.

にも☆☆☆☆☆がつていました。
これ麻酔科医にとってはとても興味深い論文です。

低酸素関連で
Hypoxia and inflammation.

N Engl J Med. 2011 Feb 17;364(7):656-65.

Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease

N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.

の二篇NEJMに出たのには感動しました。
この世界Nature, Cellといっても十分でなくNEJMに総説として取り上げられてやっと一人前という世界ですから。

最後にぼくの研究室の論文を紹介してお終いにしたいと思います。
Hydrogen Sulfide Inhibits Hypoxia- But Not Anoxia-Induced Hypoxia-Inducible Factor 1 Activation in a von Hippel-Lindau- and Mitochondria-Dependent Manner

Antioxid Redox Signal. 2012 Feb 1;16(3):203-16. Epub 2011 Oct 17.

院生の甲斐さんの論文です。
これは結構引用される論文になると思います。

気がついた論文を列挙してみました。

今年☆☆☆☆☆をつけた論文が20篇ほどありました。☆☆☆☆で 10篇くらいです。ですので紹介したのはほんの一部です。

というわけで今年もこのブログ愛読ありがとうございました。
今の職場を辞めるまで続けると思います。

それでは皆さんよいお年をお迎えくださいませ。関連するエントリー:

• ハイポキシア生物学の2010年を振り返って
• 植物の低酸素応答の分子機構
• カンテツ
• ほんと困ったものです
• 寒い!

映画館は「るろうに剣心」が大入り。アニメが好きそうとは思えない普通の女子で満員でした。ーちなみにぼくと家内は別の映画を観ましたー。
映画の最中に下痢になり10分ほど退場。何だったんだろう。グリューワインの呪いかもしれません。

上の階の映画館では「サルトルとボーヴォワール　哲学と愛」をやっていたようです。
その影響でもないのですが，帰りに立ち読みしたのが

「普通のダンナがなぜ見つからない?」です。

オーネットという結婚相談所の重役さんが書いた本です。その意味では，
「婚活したらすごかった」とはだいぶ趣が異なります。

「普通のダンナ」ってなかなかいないのだそうです。存在率0/8%。
〈会話普通50％×身長普通50％×清潔感普通50％×ファッションセンス普通50％×学歴普通50％×年収50％≒0.8％〉
オーネットってすごいですね。入会に10万9800円かかりますし、月々1万4280円も掛かるのだそうです。

ぼくも今年でもう22年以上結婚が続いています。家内は「ぼくを拾ってやった」と今でも言い続けています。

これまた土曜日の朝に，仕事をしていて淀井淳司先生が現在の所属をどうされているか調べるためにpubmed検索していたら日本血液学会の英文雑誌に

The discovery of ATL: an odyssey in restrospect.

Int J Hematol. 2011 Nov;94(5):423-8.

というエッセイが出ていることを発見しました。
早速読みました。
淀井さんが高月先生らと後にATLと呼ばれることになるT-cell lymphocytic leukemiaの二症例をNew England J Medに発表したのが1974年です。
吉田光昭先生らがウイルスを単離したのが1982年でIL-2 receptorのalpha chain (Tac抗原)のcDNAが単離されたのが1984年です。
内山卓先生はすでにお亡くなりになっていますが，高月清先生をはじめとしてこのエッセイの多くの登場人物に実際に会って話をしたことがあります。淀井さんからよく聞かされた話ばかりで知らないことは何も書いていないのですが文章となって並ぶと感慨深いものがあります。
初めて読む人には登場人物が多くてすこしと思います。なんでこの人とこの人が関係あるのとかも思うかもしれません。でも関係があるのですね。

淀井さんは結局このATL研究からADF(ATL-derived factor)を経てThioredoxinと来てTXNIPにたどり着かれました。留学中にやっていたCD23とかGIF研究も結局TRX研究に収斂していくのですからすごいとしかいいようがありません。
この物語の最後の15年くらいついてはぼくも生き証人です。
ぼくが淀井研に参加した時の話題の一つにNF-kBのレドックス制御という問題がありました。結局この問題の延長線上にぼくの学位論文も存在して院を終わってからしばらくはこのラインの仕事をしていました。ぼくは，ここから派生して低酸素の研究に移行しました。この間の事は
「麻酔」という雑誌の特集号に「周術期医学としてのハイポキシア生物学の探究」としてまとめてみました。

淀井さんのエッセイの最後は

I hope this essay will give encouragement to young generations to not simply follow contemporary paradigms or dogmas, but challenge them with one’s own wild ideas.

こう締めくくられています。淀井さんがいつも話していたことです。ATLの臨床からTXNIPまでつながる研究は確かにまったくもって淀井さんのオリジナルな研究のラインだと思います。その意味で天才です。（今日はすこしほめすぎました）

最後に久々に今日のtweetです。

ぼくは実験を始めて数年は全然データが出ませんでしたが，そのうちにすごく実験がうまくなりました。ネガティブデータはでるが実験を失敗するということが無くなったのです。たまに失敗すると誰かが邪魔しているんじゃないかとか思ったりしました。実験なんて右のモノを左に移しているだけですから極めたらほんと極まるわけです。何事も精進です。
< 追記>
すごい先生方はここに「祈る」というステップが加わります。
「—夢みて行い，考えて祈る—」です。関連するエントリー:

• 業務命令以外は話しかけないで下さい。／どうしてもと言うのならお暇を頂きます。
• 生化学データにとって美とはなにか
• 曲学阿世の徒/マジなヘンテコ
• Challenging to use our love and knowledge of science to spark a sense of wonder and excitement in a new generation
• molecular-gastronomy

少し前の”Science”に研究結果の再現性についての特集がありました。ここでもすこし紹介しました。

少なくとも自分の研究室でのデータの再現性こそ実験研究者が死守するべきものだと思います。
しかし実験結果が再現できないということはしばしば起こります。素粒子が研究対象であるような場合には対象に内在する問題があるのかもしれませんが，生物学では一般にそのようなことが原因という訳ではありません。
高尚な理論的な議論は置いて，量的な問題と質的な問題に分けてぼくの対処法を書いてみます。

量的な問題
1．他の研究室の実験結果と自分たちの実験結果に量的に異なる場合
例えば，ある物質がある遺伝子の発現を25倍は誘導すると他人が報告しているときに自分たちは5倍の誘導しか観察できない場合があったとします。このようなことはよくあります。RT-PCRで検討している場合でもreporterを用いる場合でも世界中で全く同一の実験系を用いているわけではありませんからこのような量的な差は容易に生じます。一般にこのような差を大きな問題として取り上げることはないと思います。
ただiPS cellみたいに効率が問題となる場合やニュートリノの速度のように量自体が問題となっている場合はあると思います。
いくら樹立細胞株でもepigeneticな変化が起きている可能性はあります。HeLa細胞，HEK293細胞と云ってもぼくらの研究室にあるものと隣の研究室のものとはある側面に置いては違いはあるかもしれません。

2. ある実験者のデータが量的にばらつく場合
一方自分で同一の実験系を用いていて例えばある時には25倍，またあるときには5倍となっているとすれば実験条件などを検討して改善を目指します。細胞の培養日数などをチキンとそろえる，温度をしっかりと管理するなどなど自分でしっかり実験をコントロールする必要はあります。こうした工夫の末，ばらつきがある範囲に収まればめでたしめでたしですがそうで無い場合はデータの扱いに悩むことになります。同じ研究室の別の人の”手”を借りることになるかもしれません。

質的な問題
これはすこし厄介です。

1．他の研究室の実験結果と自分たちの実験結果が質的に異なる場合
この場合気にする人は気にするかもしれませんがぼくはあまり気にしません。自分の研究室内で明確にで再現が取れるのであればそれを信じます。他人がやった事などどれくらいの精度で行われたのか解らないから問題にし無い場合がほとんどです。
2. 自分の研究室の過去のデータと現在のデータが質的に異なる場合
これは「1」に比べればよりシリアスな問題です。原因を探ります。PCRのprimerやplasmidに原因が見つかることもあります。細胞の培養方法に違いがありそれが原因のこともあります。とにかくこれは結構しつこく追究します。解決しない場合もありますしあっさり解決がつく場合もあります。
いくら樹立細胞株でもepigeneticな変化が起きている可能性はあります。HeLa細胞，HEK293細胞と云っても数年間のHeLa細胞，HEK293細胞とはおなじ出ない可能性はあります。
3. ある実験者のデータがある実験者で質的にばらつく場合
実験をはじめたばかりの実験者であれば「手」が安定するのを待つことになります。研究の方針を立てるためにまず上級者に実験を代行してもらうときもあります。それでも解決できなければ「筋が悪い」のでその実験はストップということもあります。

いろんな観点から再現性は挑戦を受けます。だから研究っていかがわしいと思う人もいると思います。
でも自分の研究結果が何百回も引用されていく過程を見るのはとても爽快です。

土曜日の夜に皆既月食があり自宅で見物できました。
基本晴れの夜空に雲が漂い月食が重なり幻想的な天体ショーを堪能できました。いくら思い出そうとしても土曜日ほど見事な月食を過去に観たと記憶はありません。
現代の天文学の水準では，この月食が何日の何時から何時まで起こるのかを正確に予想できるわけですが(まさに天地明察です），少なくとも江戸時代にはこのような事は不可能でした。このような暦とか天体の動きを支配するのは「神」でありこれが正確に予想できると言うことは神の意志を代弁者と思われるのも無理は無いと思います。だからこそ暦を支配するということが重要視されていたのだろうと思います。

今日出勤の時に撮った写真です。

古今和歌集に

春の夜の夢の浮橋とだえして峰にわかるる横雲の空

という歌があります。季節は違います-もちろん春にも似たような雲が観察できます-がおなじ光景を定家も見ていたのだと思います。

柴谷篤弘さんをテーマにしたシンポジウムが開かれるようです(参照）。関連するエントリー:

• ”見下してはいないが失望はしている”
• HeLa本
• 疑問氷解または持つべきものはよい共同研究者
• 今週の一押し:2008-#34: “Bad science”
• “過剰と破壊の経済学”を読んで

この論文では結構重要な事を主張しているとぼくらは思っているのですが解らない人には解らないようです。

PLoS ONEですから一旦出版されれば無料で読むことができます。

General anesthetics inhibit erythropoietin induction under hypoxic conditions in the mouse brain

Background: Erythropoietin (EPO), originally identified as a hematopoietic growth factor produced in the kidney and fetal liver, is also endogenously expressed in the central nervous system (CNS). EPO in the CNS, mainly produced in astrocytes, is induced under hypoxic conditions in a hypoxia-inducible factor (HIF)-dependent manner and plays a dominant role in neuroprotection and neurogenesis. We investigated the effect of general anesthetics on EPO expression in the mouse brain and primary cultured astrocytes.

Methodology/Principal findings: BALB/c mice were exposed to 10% oxygen with isoflurane at various concentrations (0.10-1.0%). Expression of EPO mRNA in the brain was studied, and the effects of sevoflurane, halothane, nitrous oxide, pentobarbital, ketamine, and propofol were investigated. In addition, expression of HIF- 2α protein was studied by immunoblotting. Hypoxia-induced EPO mRNA expression in the brain was significantly suppressed by isoflurane in a concentration-dependent manner. A similar effect was confirmed for all other general anesthetics. Hypoxia- inducible expression of HIF-2α protein was also significantly suppressed with isoflurane. In the experiments using primary cultured astrocytes, isoflurane, pentobarbital, and ketamine suppressed hypoxia-inducible expression of HIF-2α protein and EPO mRNA.

Conclusions/Significance: Taken together, our results indicate that general anesthetics suppress activation of HIF-2 and inhibit hypoxia-induced EPO upregulation in the mouse brain through a direct effect on astrocytes.

このシリーズはこれに続いて最低二報出すつもりです。

少し前に”Antioxidants & Redox Signaling”に甲斐先生の論文が出たのですが紹介していませんでした。

Hydrogen Sulfide inhibits hypoxia- but not Anoxia-induced hypoxia-inducible factor 1 activation in a von Hippel-Lindau- and mitochondria-dependent manner

Antioxidants & Redox Signaling

Abstract

Aims: In addition to nitric oxide and carbon monoxide, hydrogen sulfide (H(2)S) is an endogenously synthesized gaseous molecule that acts as an important signaling molecule in the living body. Transcription factor hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) is known to respond to intracellular reduced oxygen (O(2)) availability, which is regulated by an elaborate balance between O(2) supply and demand. However, the effect of H(2)S on HIF-1 activity under hypoxic conditions is largely unknown in mammalian cells. In this study, we tried to elucidate the effect of H(2)S on hypoxia-induced HIF-1 activation adopting cultured cells and mice.
Results: The H(2)S donors sodium hydrosulfide and sodium sulfide in pharmacological concentrations reversibly reduced cellular O(2) consumption and inhibited hypoxia- but not anoxia-induced HIF-1α protein accumulation and expression of genes downstream of HIF-1 in established cell lines. H(2)S did not affect HIF-1 activation induced by the HIF-α hydroxylases inhibitors desferrioxamine or CoCl(2). Experimental evidence adopting von Hippel-Lindau (VHL)- or mitochondria-deficient cells indicated that H(2)S did not affect neosynthesis of HIF-1α protein but destabilized HIF-1α in a VHL- and mitochondria-dependent manner. We also demonstrate that exogenously administered H(2)S inhibited HIF-1-dependent gene expression in mice.

Innovations: For the first time, we show that H(2)S modulates intracellular O(2) homeostasis and regulates activation of HIF-1 and the subsequent gene expression induced by hypoxia by using an in vitro system with established cell lines and an in vivo system in mice. Conclusions: We demonstrate that H(2)S inhibits hypoxia-induced HIF-1 activation in a VHL- and mitochondria-dependent manner.

硫化水素の低酸素応答への影響を調べました。島根医大の竹永先生から供与していただいた細胞が大活躍でした。
関連するエントリー:

• 論文通りました
• 論文がアクセプトされました
• 論文が通りました
• 論文が出ました
• 正式にaccept

会の運営の実力を出していたただいた学習院大学大学の中村研究室、東京工業大学の近藤研究室の学生さん方ありがとうございました。
次回の研究会は2012年の晩秋に横浜市で開催の予定です。次回で10年です。特別の趣向を用意したいと思っています。

というわけで今回の研究会の雑感は明日以降に。

あの時間に焼き豚二枚をペロリと食べる”若い”人たちに脱帽

Posted from my iPad関連するエントリー:

• 世界の終わりに残って
• 映画「奇跡」の奇跡
• dPad導入して見ました
• 静脈麻酔学会と第9回がんとハイポキシア研究会一日目
• 「生命と自由を守る医療政策」を読んで

午前中は静脈麻酔学会@京都、

午後はがんとハイポキシア研究会@学習院大学、

でした。

そう大量に呑んだ訳でもないのですが、東京の人たちの毒気に当てられました。

au-iPhone4Sですが時々◯が出ますね。東京は。

というわけで今日は寝ます。

どうも某学会でtaroが賞を取ったようです。ヒイヒイ言いながら頑張った甲斐があたっというものです。

Posted from my iPad関連するエントリー:

• 「大学および各種教育研究機関における研究活動推進振興法」のある世界ー短編集「あがり」
• Twitter Weekly Updates for 2010-11-07
• 世界の終わりに残って
• 映画「奇跡」の奇跡
• 第9回がんとハイポキシア研究会終了しました-来年は横浜です

HIFネタです。ホント最近すごいですよね。特に”Cell”系の雑誌でのHIFのモテ方は異常なくらいです。
ぼくが研究を始めた頃は年間の論文の数は20−30篇くらいで全然流行っていなかったのですよ。それが今や一日3篇から4篇は出版されるのですから…

Hypoxia-inducible factor 1-mediated human GATA1 induction promotes erythroid differentiation under hypoxic conditions.

J Cell Mol Med. 2011 Nov 3. doi: 10.1111/j.1582-4934.2011.01484.x.

これって結構重要な感じがします。だってGATA1とHIF-1ですよ。

Activation of the HIF Prolyl Hydroxylase by the Iron Chaperones PCBP1 and PCBP2

Cell Metabolism, Volume 14, Issue 5, 647-657,

これには驚きました。執念とも言えるかもしれません。

amazon.comに注文してた“1Q84”が今日到着しました。送料込みで＄21.52です。
Kindle版で読んだのですがやっぱり本がほしかったんです。

装丁がいいです。

よくある表紙の写真ですがカバーを外すと

こうなります。

後ろの表紙は

こうですがカバーを外すと

です。

青豆と天吾。

背表紙は

が

こうです。
表紙をめくると

月が二つの1Q84です。

ちなみに，使われているFONTは今回は”Minion”です。ぼくのMacには入っていました。

関連するエントリー:

• 今年最高と言い切ってしまいます
• 常識に挑戦している訳ではありません
• 疑問氷解または持つべきものはよい共同研究者
• Yahoo知恵袋の質問で今までの研究成果が試される，かも。
• 植物の低酸素応答の分子機構

Natureに植物の低酸素感知に関する論文が二つ出ています。
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants

Nature (2011) doi:10.1038/nature10534

Oxygen sensing in plants is mediated by an N-end rule pathway for protein destabilization

Nature (2011) doi:10.1038/nature10536

N-end ruleに従う蛋白質の分解が重要な鍵を握る所など似通ったところがあるというのが不思議です。
ちなみにこれらの論文で云うhypoxiaとはほぼanoxiaの条件です。

Steve Jobs氏の伝記が昨日発売になりました。
原書と邦訳の価格の差が酷いなどなにかと話題です。(参照）
確かにひどい商売です。
ぼくはナイーブに翻訳を注文したのですが全然発送されないので怒って注文をキャンセルしてKindle版を買いました。幸いぼくの手に負える英語ですのでこれで最後まで読もうと思います。

翻訳と云えばGroopmanの”Your Medical Mind: How to Decide What Is Right for You“の翻訳，「医者は現場でどう考えるか」）が出版されたようです。
よい本だと思います。
ついでに，最新作Your Medical Mind: How to Decide What Is Right for Youも出たようです。
ぼくはGawande氏よりGroopmanの方が知性的だと思います。

もう一冊
House and Psychology: Humanity Is Overratedは面白いです。あの”House“を心理学的に解剖した本です。テレビ番組を見たことのない人は楽しめないと思いますけど…

GLSの熱血解説に聞き入る院生達@Welch Library in JHU

二週間ほど遅れてiOS5にupgradeしました。確かに便利になっていると思います。なるべく早く”4S”にしたいと思います。

1Q84
は今現在まだぼくのKindleには流れてきていません。

来週の火曜日に大学院の入学試験があるようです。受からないことには始まりませんので時間まで答案用紙に向かってください。
関連するエントリー:

• ハイポキシア生物学の2011年を振り返って
• “The instruction we find in books is like fire”
• 「奪還」あるいは「粉々になった自我を拾い集める」試みを観て
• Kindleが
• Yahoo知恵袋の質問で今までの研究成果が試される，かも。

ASA では外国からのpaperはそれだけを集めたセッションを開いているそうです。
それはそれでよく解ることなのですがなんか妙な感じもします。
またポスターを貼っただけでポスターの前に誰もいないというpaperが今日のぼくらのセッションだけで5つもあってそのうち4つは日本の同一施設からのpaperでした。
よいこととは言えないと思います。

そもこういった規模のmeetingというのは機能していないと感じました。

実際に米国で働いている日本人の先生，米国人と話すと日本の麻酔科医への日本麻酔科学会の意味合いと米国人の麻酔科の医師にとってのASA meetingの意義は全く異なるということがn=2ですが解りました。

日本も巨大学会はもうやめたらどうかなと思います。

その後東北大学のご一行とステーキを食べに出かけました。

普通においしく堪能しました。

というわけでぼくの多分生涯最後のASA meeting出席は終わりました。
明日はBaltimoreに向けてChicagoを立ちます。
関連するエントリー:

• ASA2011 Day1
• ASAにJSA分科会をつくってもらったらどうなんでしょうか
• Anesthesiology 2011雑感
• ASA2011 Day2
• ASA2011 Day(-1)

朝6時半ホテル出発です。シャトルバスが発着するホテルであることがわかりホテルの前で待っているとホントに時間通りにバスが到着しました。

程なく会場のMcCormick Placeに到着ですがRegistrationは今日は8:00からである-”@skai0627″のposter discussionが8:00からなのに-ことがわかりそれまですることが無くなりました。

内心焦って居るだろうkaiさんをを尻目に新潟大学の先生方と会ったのでコーヒーを飲みながら朝ご飯を食べることになりました。

7:30くらいになりいよいよとなるも今度は会場がどこか解らなくなり右往左往としてようやく会場にたどりつくとなんと5人くらいしか人がいません。

Modulatorの優しそうなおじさんはすでにいました。時間が無かったのでregistrationができていないことを伝えると別に構わないと云うことでそのご簡単な打ち合わせのあと8:00になりセッションが始まりました。

部屋の前方の結構なしつらえの演壇を使うのでは無くポスターの前に皆であつまる形式で行うことになりました。kaiさんは二番手に指名されました。

撃沈かと思われたのですが，された質問にはやさしいmoderatorのおじさんが答えてくれてtalkは乗り切りました。

健闘はしたと思います。

その後ぼくはregistrationを済ませポスター会場に向かいました。どうしてもお話をしておきたい先生（日本人）がいてポスターを展示している間に行きたっかたのです。間に合って話すことができました。彼のアメリカでのsupervisorの気の良よさそうなお兄さん風の先生とも話せました。

その皆と合流してお昼はMacdonald。すごい行列が出来ていました。

出たところに靴磨きのコーナーがあるのですがこれがまた繁盛しているのです。数えてみたら30分で8人くらいお客さんが来てました。お値段は片足で$5, 両足で$7です。

何でこの学会に出席してあの時間に靴を磨いてもらう必要があるのかがとても不思議でした。

午後はdajoさんのポスターです。

プレゼンの時間が来てかなり追い詰められていた感じですがanothor moderatorのおじさんがうまくまとめてくれてこえまためでたしめでたし。kaiさんのポスターを絶讃していたmoderatorrが再度現れ絶讃していったということです。
明日のぼくらのポスターまでこのおじさんがきたらこれは本物ですね。1人くらい差しだそうと思っています。

ポスターが終わりいよいよApple Store詣です。すごい人です。たぶん全部お上りさん。
Unlocked iPhone 4Sはありませんでした。デブの店員さんとヤセお店員さん2人に確認したところ11月からであるということでした。

その後「正しい」お上りさんとしてJohn Hancock Observatoryに昇って見ました。

すごい景色でした。

その後歩いてJapan Nightへ。これはなんかよく解らんかったですね。もう二度と来ることもないでしょうかどうでもいいですけど。

Daizo先生のパワーに圧倒されてあっけなくお終いになりました。

関連するエントリー:

• ASA2011 Day1
• ASA2011 Day3
• Anesthesiology 2011雑感
• ASAにJSA分科会をつくってもらったらどうなんでしょうか
• 全員演題採択!!

米国からも折に触れてエントリーの投稿をしていこうと思っています。

某研究費の申請は今日の午後で自分が研究代表の分と分担の分一つは終わりました。もう一つ分担の分を代表の先生と仕上げれば来年度向けの申請はお終いです。
いつも思うのですがあの分量でどうやって審査して採択をきめるのでしょうか。不思議です。
また科研費は期間が終われば報告書を提出してお終いです。費用対効果など誰も問いません。これも不思議です。
ともかく，申請書はもう少し分量を多くして研究の詳細をもう少ししっかりと書き込むようなものにしていってもらいたいとぼくは思っています。ちょっとした思いつきの申請が無くなると思います。

「科学研究費助成事業における審査及び評価に関する規程」が公表されています。
学識を有した教授，准教授の先生方が審査をしてくれるのだそうです。審査区分は「麻酔科学」で出していますからぼくを知っている人が審査を担当してくれるのだと思います。
提案の新規性とかも大切ですが実現性にも目を向けてほしいと思います。過去5年で論文が3つとかの申請が計画通りに進むとかはあり得ないと思います。余り書きすぎると問題も出てくるかもしれませんのでこれくらいで。

結局iPhone4Sはおろか，iOS5にもupgradeできないままでした。関連するエントリー:

• Anesthesiology 2011雑感
• ASA2011 Day3
• ASA2011 Day1
• ASA2011 Day2
• とっとと学位もらって下さい

麻酔後の診察でえらく話し込んでしまいました。いろんな人がいろんな事を考えるのですね。

いろいろと滞っていた事に殆どケリをつけることができたました。査読も全部捌けたし，某原稿も今朝送りました。やっていないのはこれのビデオ編集だけです。
論文の作業も本格的に再開します。
科研費の作業も始めます。

PLoS ONEに
Analysis of Hypoxia and Hypoxia-Like States through Metabolite Profiling

PLoS ONE 6(9): e24741. doi:10.1371/journal.pone.0024741

が載っていてこれはやられたなと言う気がしました。この観点はとても重要だと思います。

月曜日に「最後の忠臣蔵」という映画をケーブルテレビで見かけて結局最後まで観てしまいました。
ストーリーはたわいもないもので最初から結末が解っているようなその意味では底の浅いとも言える映画でした。たぶんテレビの二時間ドラマくらいでちょうど収まるようなそんな感じの映画です。

赤穂浪士による討ち入り直前に”逐電”した瀬尾孫左衛門が実は大石内蔵助の命を受けて”隠し子”「可音」を乳飲み子の時代から立派に育て上げ京都の豪商に嫁がせてその後…

という映画です。

伏線の張り方がおかしくてちぐはぐなシーンが唐突なに出てきます。

二人の関係もなんか微妙な描き方で，「うさぎドロップス」の最期みたいな結末かもとかそんなわけはないとか思わせながらありきたりの最期を迎えるわけです。可音の入浴シーンは何だったのでしょうか。「水戸黄門」じゃないんだから。

しきりに「使命」という言葉が出ててきます。「使命」だから可音を育てたのだというわけです。

この映画，デタッチメントからコミットメントの方向性でなくコミットメントからデタッチメントの方向性で進んでいるな〜と言うような感想を持ちました。

「リトル・ピープルの時代」にはまっていていろんなことをこの本の視点から眺めてしまいます。
そんなことを考えならが観ていたら終わっていました。

偶然前の日に「うなぎ」も観たのですが，役所広司ってすごいね。二枚目過ぎるところが欠点と言えば欠点でしょうか，モテる役以外ができないというか。

iPhoneがauからも出るというニュースがあります。実はぼくソフトバンクで何も困っていないんですよね。
ぼくが重視するのはネットにつながるかどうかでいつもdocomoのモバイルWiFiルーターを持ち歩いているので”どこでも”つながります。
docomoがつながらないならこれはあきらめるしかありません。ぼくは，結局ソフトバンクでiPhone5にしちゃうような気がします。

来週，麻酔科の専門医試験があるようです。
ぼくは医者になって9年目にのこのこ受験しました。大学院を出て病院で助手になって研修中の先生の指導を初めてこれは指導医ー当時は専門医という呼び方はありませんでしたーの資格は取っておく必要があるということで受験することにしました。学会費の5年分くらい滞納していてー院生の時に破門されてグレていたのです。ー耳をそろえて払って会員資格を復活させてもらいました。
毎回研修中の先生のお昼交代の時に彼らの教科書を読んで勉強して過去問題を解いたら8割はあったので以後勉強するのを止めましたが試験には合格しました。自分では受験用には一冊も本を買いませんでした。自分で持っていたのは，「Miller」と「MGHの麻酔のてびき」のみ
落ちたら大学病院は辞めようと思っていましたが合格したので今に至ります。

筆記と面接を一緒に受験したのですが初日の筆記試験のあと合格でないと次の日の面接に進めません。N波さんと一緒に発表を見に行き合格を確かめてからその日のホテルを探すというありさまでした。牧歌的な時代だったのです。

一昔はその程度の試験だったのですが今は皆さん猛勉強しているようですね。試験というと勉強しないと気が済まない人もいるかもしれませんが何かの役には立つかもしれませんので，がんばってください。

院試，学会，JBPOTというスケジュールの先生もいるそうです。こちらもがんばってください。院試に落ちると大学院生にはなれません。
関連するエントリー:

• ぼくがダメな理由がわかった
• 当直終わり
• ”お前はすでに死んでいる”　のか？
• ”The Unwisdom of Elites”と「化粧する脳」
• タスマニアンデビル

ここ10日ほどしなければいけないいろんな作業をうっちゃって某作業に掛かっていたのですがようやく一段落です。原稿を送りました。
立った今から止まっていた作業をすべて再開しないといけないのですがちょっと休ませてください。明日くらいまでは。

でも今日いただいた某論文の原稿はすぐ読みます。
預かっている某論文の作業も進めます。
某講演会の観戦記とビデオ編集もします。
某査読も〆切通りにします。
すみませんでした。

大学院の先生方，ずっと研究室で作業していると夜遅くまでとか朝早くかとか皆ちょこちょこ研究室でがんばっていますね。

しかし，Endnoteの”style”ってかなりいい加減なモノもありますね。初めての雑誌の場合自分で一回はきちんとreviewしないと後にとんでもないことになる。関連するエントリー:

• 評判のMendeleyをinstallして使ってみた
• 査読の透明性
• Papersの有用性について
• ぼくは自分探し大賛成です-地震-Papers2
• コンピュータのファイルの名前の付け方

TRPA1 underlies a sensing mechanism for O2

というタイトルの論文が発表されました。
京都大学からもプレスリリースがありました。(参照：新たな生体内酸素センサー機構の発見）

pdf fileを高橋先生から送っていただいて一読しました。
興味深い内容ですので紹介します。

ヒトやその他のほ乳類の細胞内の酸素濃度は比較的に狭い範囲に保たれてホメオスターシスが成立しています。肺胞の分圧は110mmHg程度であり心臓、腎臓や脳での酸素分圧は部分的には20mmHg程度となっています。すべての細胞の生理学的な酸素濃度は酸素の供給と消費により決まり、酸素不足(低酸素状態)、酸素過剰(高酸素状態)などの逸脱が引き起こす生存に不利な状況を克服または適応し酸素ホメオスターシスを細胞レベルで保つための適応的な応答を引き起こします。このためには、細胞またはその集合体である組織，個体は自らのおかれた酸素濃度を何らかの形で感知する機構を備えているはずであるという論理的な要請があるわけです。

生体の低酸素応答は多分単一ではありません。その分子機序、時間的な違いなどからいくつかに分類できます。
呼吸応答に重要な役割を果たす動脈小体や低酸素性肺血管収縮など反応は、酸素分圧が60mmHgを下回る程度からきわめて迅速に通常は遺伝子応答なしに惹起されます。一方、転写因子の活性化が必要な低酸素性遺伝子応答は60mmHg程度の軽度低酸素状態で通常は惹起されないし、転写、翻訳などにある程度の時間がかかります。
このように生体の低酸素応答、低酸素センサーまたはそのエフェクターは明らかに単一ではなく多数存在する。またセンサー・エフェクターの対応は1:1の線形的なモデルでは記述できない複雑な網の目の(web)を形成していると考えるのが正しいとぼくは考えています。
今回の論文は，肺胞や動脈血に直接灌流されるような細胞がその範囲の周辺で変動する酸素分圧の変化をどう感知して生体応答につながっているのかを説明する有力な考え方の一つになると思います。

論文によれば10%程度の酸素分圧ですでにTRPA1には変化が生じるようです。PHDがHIFaの制御形式から考えるとこれはすこし高いという気もしますが，PHDのKmはそもそも結構高いので実は鋭敏な低酸素応答系ではこの程度から低酸素応答が実際にはじまるのだと考えることもできます。
HIF-1のプロリン残基とPHD2の反応では周辺配列の違いなどからすこし反応曲線というかKmがすこし異なるのかもしれません。ここらへんも実証できればこれまたすばらしいし今後もう少し詰めていかれるべき課題と考えています。

また高酸素状態で一過性に呼吸回数が増えるような現象がこのチャネルの性質で説明できれば従来の呼吸整理の教科書も一部は完全に書き換える必要がでてくるかもしれません。

HIF-1aのKO miceでは動脈小体の酸素分圧感知・呼吸制御に異常が起こることが知られていのですが，HIF-1からTRPA1への何からの影響もあるのかもしれません。

またTRPA1のシステイン残基が酸化修飾を二段階に受けるとしてそれを還元する系はどの還元酵素系に担われているのかなど興味は尽きません。

その他いろいろな事が思い浮かぶのですがこれ以上書くとぼくらのする仕事と関係が出てくるのでこれくらいで。

論文自体やプレスリリースは正確に記載されていますが，今回の論文の文脈ではTRPA1は酸素分圧センサーではありません。そのエフェクターの一つです。

イオンチャネルタンパク質TRPA1が「O2センサー」としてこの両義性に対応するために機能することを突き止めた。

という記述が京都大学のプレスリリースにありました。
その文脈で，低酸素センサーはPHDとしてももう一方のセンサーはどう考えるべきなのでしょうか？ 活性酸素による緊張性な酸化修飾に対抗する還元系が支配的に働くのかやはり産生系が制御的に働くのか興味が引かれます。

先日の島岡セミナー関連です。
講演の中盤で，臨床医時代にふれあった外科医師，大学院生時代に師事した教授らとのふれあう過程でかけてもらった「言葉」や「薦め」を自分なりに咀嚼して”恐れながら一歩踏み出すということの重要を語っておられました。
人間誰しも跳ぶのは怖いのですが，「見るまえに跳べ」
ということもあります。
上司や師匠はすごくよく人を見ています。毎日朝から晩まで一緒にいて一挙手一投足を観察しているのですから当然です。
なので，上司，師匠のアドバスイというのには重みがあります。研究に向いていない人に研究しろとは云わないし，外国では無理かもと思う人には外国に行ってはどうかなどと云わないものです。
まして無謀なジャンプを強要することもありません。
上司をたまたまの上司と思うだけでは物事は動きません。究極の師匠では無いかもしれませんが上司も一次的には師匠です。
関連するエントリー:

• ハイポキシア生物学の2011年を振り返って
• 酸素分圧感知機構，ホメオスタシス，疾患
• MH
• 「基礎医学の教授に医師がいなくなってもいい」と思います
• 島岡要先生のセミナー盛況のうちに終了!!

300人くらいの聴衆に集まってもらいぼくは満足です。
観戦記とか講演の様子などは追々公表していくつもりです。


関連するエントリー:

• 酸素分圧感知機構，ホメオスタシス，疾患
• 「新たな生体内酸素センサー機構の発見」の論文
• ニセ医者ーエセ医師
• 小林久隆さんのセミナー
• 8月26日に京大医学研究科で三重大学教授 島岡要 先生のセミナーを開催します