The Transcriptional Repressor DEC2 Regulates Sleep Length in Mammals — He et al. 325 5942: 866 — Science.

DECってあのDECですよ(Identification of Functional Hypoxia Response Elements in the Promoter Region of the DEC1 and DEC2 Genes — Miyazaki et al. 277 (49): 47014 — Journal of Biological Chemistry.)

iPhoneでも結構なのが撮れますね

麻酔科の学会が日曜日から神戸であります。暑そう。ー公式にはノーネクタイでということなのですが…
以前に紹介したことがありますが、“酸素はからだになぜ大切か―いつも酸素は不足している! (ブルーバックス)” (諏訪 邦夫)というブルーバックがあって1990年に出版なのです。内容がまったく色あせないのがすごい！！この本に書いてあることを分子生物学の言葉で説明するというのが究極の目標です。今回は、臓器保護の新戦略と云う事に力点を置いて話してみます。麻酔科の世界で今話題になっている臓器保護とはまったく角度が異なるものを話します。どうでしょうか

[追記」番外-1 at Lack of Oxygen and Beyond.書きました。

すごい本もう一冊
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Institute of Medicine Calls for Doctors to Stop Taking Gifts From Drug Makers

という記事が。

Much of this money is spent on giving doctors free drug samples, free food, free medical refresher courses and payments for marketing lectures.

”free”はいかんということで1000円とか500円の会費制にすると言う方法もあるし、根は深いね。

NEJMでは

Controlling Conflict of Interest — Proposals from the Institute of Medicine

JAMAでは

Professional Medical Associations and Their Relationships With IndustryA Proposal for Controlling Conflict of Interest

Institute of Medicineからは

Conflict of Interest in Medical Research, Education, and Practice

こんな本が出ているのですね。

ブタインフルエンザ関連で驚いたのはこれ

1976: Ford Orders Swine Flu Shots for All

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Science 3 April 2009:
Vol. 324. no. 5923, pp. 98 – 102
DOI: 10.1126/science.1164680

こりゃすごい

言っていることもすごいが方法がもっとすごい。

素直に脱帽。

Inactivation of sodium channels underlies reversible neuropathy during critical illness in rats

J. Clin. Invest. doi:10.1172/JCI36570.

これもすごい。

CHARGE syndromeという疾患があります。

麻酔をしました。症例報告しました。二三行書き直すと麻酔科学会の某英文機関誌に載せてくれるそうです。

H先生おめでとう。

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Politics in the Guise of Pure Science

オバマ大統領は就任演説で

We will restore science to its rightful place, and wield technology’s wonders to raise health care’s quality and lower its cost. We will harness the sun and the winds and the soil to fuel our cars and run our factories. And we will transform our schools and colleges and universities to meet the demands of a new age. All this we can do. And all this we will do.

という言葉で、科学技術を正しく駆使して医療改革、エネルギー政策の転換を図っていくと主張していました。

その意気やよし。しかし科学技術顧問に就任した人物は果たして大統領に正しいアドバイスができるのかという趣旨の論文です。

John Holdren氏は

asked about some of his gloomy neo-Malthusian warnings in the past, like his calculation in the 1980s that famines due to climate change could leave a billion people dead by 2020. Did he still believe that?

かつて上院の公聴会でかつての彼の主張について質問を受けて往生際の悪いことに

he insisted that it was still “a possibility” that “we should work energetically to avoid.

との返答を行ったということです。

こんな人物に科学技術顧問を任せておいて

Will Mr. Obama’s scientific counselors give him realistic plans for dealing with global warming and other threats?

なのかという主張です。

曲学阿世という言葉がありますが、それならそれで受け止め方もあるのですが、マジでへんてこなアドバイスを繰り出し大統領がその気になったら大変なことになりますね。

日本でも少し前に一部の人間のアドバイスを真に受けた厚生労働省によって医師養成プログラムにとんでもない変更が強いられ、某内閣の政策と相まって医療をめぐる光景が数年の間に一変してしまいました。

麻生氏は本当に訪米したのでしょうか？

NYTを探したのですが記事になっていません。その程度の扱いなのですね。ちょっとびっくり。

北野武の「アキレスと亀」のDVDレンタルが始まっていました。個人的には、某受賞作よりこっちの方に思い入れがあります。

もう帰って寝ます。今日は無理、明日投稿します。

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今年はCharles Robert Darwin生誕200年にあたります。

毎日新聞でも元旦に特集をしていました。なかなか気合いの入ったよい特集でした。

昨年大阪でもかなり大きな展覧会が開催されました。

最新号のScienceもDarwinの特集を企画しています。今後数回にわたりいろんな角度からのessayを掲載していくそうです。

ちなみに今年は太宰治生誕100年だそうです。どうでもいいですけど。

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(参照）

タイトル通りの内容

生い立ちの記述は少なくほぼいきなり衛生兵として参加したベトナム戦争の体験から始まる。1946年生まれでこのような世代なのだ。

ヒトゲノム解読における”公的チーム”ー米国政府の出資による解読チームーとの競争に多くの記述がさかれている。所々かなり辛辣な批判はありますが原文を参照したわけではないのでニュアンスはよく解りません。

最終章は”青い惑星と新しい生命”と題されていて彼らの最近の活動が紹介されています。

D. G. Gibson, G. A. Benders, C. Andrews-Pfannkoch, E. A. Denisova, H. Baden-Tillson, J. Zaveri, T. B. Stockwell, A. Brownley, D. W. Thomas, M. A. Algire, C. Merryman, L. Young, V. N. Noskov, J. I. Glass, J. C. Venter, I. Hutchison, Clyde A., and H. O. Smith. Complete chemical synthesis, assembly, and cloning of a mycoplasma genitalium genome. Science, 319(5867):1215–1220, 2008.

この論文はその最新の成果の一つだと思います。生命体のゲノム配列を化学合成したというものすごい話です。

基礎生物学の到達の一つの頂点だと思います。材料を与えられて例えば細胞を一つ作り出せたらもっと話を進めれば眼や肝臓を化学的に作り出すことができればこれをもって細胞、眼、肝臓をヒトが完全に理解したといってもぼくはよいと考えています。-生物的につくる計画は着々と進んでいるわけですが..-

所々挿入される囲み記事は、自らの遺伝子配列ー彼のゲノム配列は公表されています。ヒト個体完全ゲノム情報で、二倍体ゲノムのすべての相同遺伝子を含んでいますーに基づく遺伝子談義です。 p215では Klotho が取り上げれれています。記述は正確ではありません。-他も推して知るべしか- しかしここまで細かいところは無理だろうな。そもそもあまりおもしろくありません。

全体として、ベンター氏の具体的な考え方がしっかり示されていて為にもなります。

教科書として使われてもいいかもしれません。

ワトソン氏の “The Double Helix”よりはおもしろいと思います。イヤみも無いし。

原文を参照したわけではありませんが訳文で引っかかる部分はありません。よい翻訳だと思います。

というわけで2009年もよろしくお願いします。

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積み上げてあった雑誌の位置を動かしゴミを捨ててかなりのスペースを確保。

そうか本棚が一つは必要だと考え帰宅後自動車で神戸港島のIKEAへ。意外に近いというか阪急電車ーポートラーナーで出かけるのとほぼ同じ時間で到着。ーということはここら辺の病院は就職先の候補ということかー

アメリカ時代に愛用していたPOÄNGも一緒に購入。家で組み立てようとしたら部品の一部に不良を発見。電話をかけたら受付時間を過ぎていたので今朝連絡したところ、該当部部品のみ配送交換してもらえそう。

オペレーターの方が機関銃の様にしゃべっていました。

臨床医学に一例報告というものがあります。何であれ頻度は低いが新奇性が高いまた教訓となるような内容を含んだ報告です。医局のカンファレンス、研究会・学会、また論文として発表されることもあります。

その中には

–

複数菌の敗血症を反復した代理Munchausen症候群の１例

＜要旨＞

敗血症を反復した代理Munchausen症候群(MSBP)症例を報告した。患児は発症時７ヶ月の女児。下痢と発熱を主訴に入院した。入院後から複数菌による敗血症を反復した。腸管や免疫能に異常なく、同様の経過で死亡した姉の存在、後に判明した母親のMunchausen症候群の既往等からMSBPと診断した。母親による点滴回路の意図的汚染と考え母児分離した。母児分離後、患児の状態は著しく改善した。MSBPは医療機関への異常な依存であるが、その原因の一端に母親自身の不幸な成長過程や家庭環境が関与していると推察される。社会全体が育児をもっと高く評価し、家族機能を補完するような支援をしていくことが急務である。

（日本小児科学会雑誌　１１０巻５号　681～686 2006年）

–

のようなものもあるわけです。

こういった一例報告ですが、学会レベル以上では新奇性が求められタダ単にまれな疾患をもった患者さんの報告というだけでは発表の機会を与えられないことが多くなってきています。

また実験医学の領域でもいわゆるnegative dataは通常雑誌に発表されることはあっても公刊されることは特別な場合を除いてはまれです。

Collective Intelligence(集合知）という概念があります。

代謝経路やシグナル伝達の知識なんて元々「集合知」(Collective Intelligence)。いろんな人が、いろんな組織や細胞種、さらには生物種で実験した「パッチワーク」。それらのデータの質をあまり吟味しないで「統合」するのも結構なのかもしれないが、それでは永続的には使えないだろう。典拠をしっかり示し、如何に分かっていないかが判るのも「データベース」の役割として今後求められるのではないだろうか。

というような考えに基づけば研究発表も新奇性だけにとらわれず何でもかんでもとにかく「データベース」に収録されないことには動き出さないということがあります。研究者の生の実験ノートで作られた「データベース」ができればとりあえず目的は達成なのでしょうか。とうことは無いだろうからむずかしい。

もちろん、ぱっと見では矛盾する事実が載っていることもあるかもしれない。単純化のレベルや立脚している仮説が違うとそうなるということがむしろ判る形の「データベース」。そういうものにしていくにはどうすれば良いのか？ただ、「集合知」で利用者の入力を促すだけではダメだろう。その辺、考えていきたい。

本当にうまい仕組みを考えてもらいたいものですというかこのような事を考える枠組みも必要ですね。

もっと考えた事もありますが今日はこれくらいです。

“Originally Collective Intelligence”(参照）に 触発されて書いてみました。

今上天皇が論文を公刊したとの新聞報道がありましたがこんな考察を発見。負けるわけにはいかないと思ってしまいました。

これからは”統合”か、キーワードは。

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Towards responsible use of cognitive-enhancing drugs by the healthy

Nature 456, 702-705 (11 December 2008) | doi:10.1038/456702a; Published online 10 December 2008

なんとか手に入れて読んだ方がいいと思う。

以前にNatureに科学者の2割くらいがリタリンを使っているとかの報告が出ていたような気がする。

ぼくがいまいちなのはもしかしたらそのせいか？な訳はない。

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What other treasures could be hidden in conference papers?

Nature 456, 443 (27 November 2008) | doi:10.1038/456443a; Published online 26 November 2008

という文章が載っていました。

学会の抄録などはいわゆるpeer-reviewed paperとは意味合いが異なるが、軽々には扱えない侮れないものもあるよ、というような主張です。

例として島津の田中さんがノーベル賞を取るきっかけになったTanaka, K. et al. in Proceedings of the Second Japan–China Joint Symposium on Mass Spectrometry (eds Matsuda, H. and Liang X. T.) 185–188 (Bando, 1987).が挙げられていました。ー本当にこれがきっかけなのでしょうかー

例えば日本麻酔科学会の年会の抄録はほとんどの場合日本語で記載されていてpubmedにも収録されません。

一方ぼくの記憶が確かなら、AHAのannual meetingのabstractは英語でpubmedにも収録されています。

最低英語で書かなければたしかにどうしようもありませんね。

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今日夕ご飯の時にテレビを見たのですが巷では驚くようないろんな事件が起こっているようです。

“Bad Science” (Ben Goldacre)

エセ科学とか疑似科学とかいう言い方がありその例としてマーチン・ガードナーが『奇妙な論理』が例として挙げたものがwikipediaで見ることができます。

思い切って云えばこの “Bad Science” はそういったものの批判書です。著者が英国のGuardian紙で連載していいる”Every Bad Science column”への寄稿をふくらませたものです。表現は激しい場合もありますが基本的には常識的な内容です。それでもおもしろいエピソードや表現は満載です。

例えば

If you want to your research in the media, throw away the autoclave, abandon the pipette, delete your copy of Stata, and sell your soul to a PR company

などの”毒”も随所にちりばめられ結構楽しめます。学会なのに手術室に引きこもっていては”有名には”確かになれません。

“Bad Science” (Ben Goldacre)

目次を挙げておきます

1. matter

2. brain gym

3. the progenium XY complex

4. hemopathy

5. the nousence du jour

6. Dr. Gillan McKeith PhD

7. ‘Pill solve complex social problem’

8. Professor Patrick Holford

9. Is mainstream medicine evil ?

10. How the media promote the public misunderstanding of science

11. why clever people believe stupid things

12. bas stats

13. health scares

14. the media’s MMR hoax

突然小林秀雄です。

小林秀雄の講演のうち録音のよいものはCDで売られています。ぼくも数枚持っています。

“信ずることと考えること―講義・質疑応答 (新潮CD 講演 小林秀雄講演 第 2巻)” (小林 秀雄)

は昭和４９年の講演を収録したものでとっかかりでユリゲラーの話が出てきます。

「”念力”などというものはある」のであり「魂はあるか？　あるに決まっているじゃあないか。」 などと聴衆を挑発しつつかれの主張が展開されていく非常におもしろい講演です。ーちなみに小林秀雄はバカみたいに話がうまい。養老孟司のCDももっているが養老さんも小林秀雄には完全に負けていますー

これでたったの4200円ですよ。でもびっくり何と4200円の講演がここで聴けるようです。freeだといっていますが…

本にも収録されています。こっちのタイトルは”信じることと知ること”“小林秀雄全作品〈26〉信ずることと知ること” (小林 秀雄)

こういった話を聞いてしまうとbad scienceとかいってもそれは何なんだというような気分にもなってきます。

自分が科学者だと思っている人や医者だと思っている人は一回は聴いてみたらいいと思います。

先日観た映画で、

「全ての現象には、必ず理由がある」とかいっていた探偵役の学者がいました。相方の刑事に「科学で証明できない事は、サッパリ理解不能なくせに」といわれて「そんな物はどこにある？」と問い返すのですが「ありますよ。たとえば“愛”」との答えに「愛？もし三角形の面積が底辺×高さ÷愛だったら、半径×半径×愛だったら・・・」とおどけて「誰にも解けません」「つまり愛などという物について考えるという事は・・・」「もう結構です。時間の無駄でした」「解ればよろしい」とつながっていきます。

魂や神について考えるのは時間の無駄なのか考えても仕方ないかのか、重要なのは魂を売り渡さないことなのか

ちなみにこのbad scienceも”Nature”で紹介されていました。

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Consciousness and Anesthesia

と題するreviewが掲載されています。

いろいろと書いてある割には渡り障りのない結論のような気もしますが読んだらためになると思います。

table1の絵はおもしろいです。今度使おう。

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Natureで紹介されていたので買っておいたのをこの休みに読みました。

例によってWatson氏の自慢話の寄せ集めなのですがこれがおもしろい。

副題はLessons from a Life in Scienceとなっていて本当にLessonsがついています。

例えばchapter 3 Manners picked up in graduate schoolで大学院時代の生活からの教訓では

1. Choose a young thesis advisor
2. Expect young hotshots to have arrogant reputations
3. Extend yourself intellectually through courses that initially frighten you
4. Humility pays off during oral exam.
5. Avoid advanced courses that waste your time
6. Don’t choose your initial thesis objective
7. Keep your intellectual curiosity much broader that your thesis object

などが挙げられていてなかなか教訓的な解説がされています。

Chapter 10はManners appropriate for a Nobel Prizeです。本当にいやらしいですね。

大学院生の抄読会などに使ってもいいかも。

英語も平易です。

amazonの在庫はOxford University Press版はあと一冊、ぼくはKnopf版を買いました。こちらはぼくが買ったので在庫無しになり二週間待ちです。

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The Language of God: A Scientist Presents Evidence for Belief

J. Watsonの後を襲って米国のヒューマンゲノムプロジェクトを率いたFrancis Collins (参照)の著作の翻訳です。

科学者とくに生命科学者であることとキリスト教の信者（コリンズ氏は、only nominally Christianである両親に育てられ若いころはatheist-無神論者-であったが医学部で学ぶ過程で福音主義キリスト教徒となった）であることが両立するのかという問題が論じられます。

コリンズ氏のあまりに率直な書き方にひどく驚きましたが、ドーキンスの『神は妄想である-宗教との決別』やグールドの『神と科学は共存できるか？』よりは親密な感情を抱きながら読み進めることができました。

圧巻は第11章「真理の探求者たち」だと思います。よくここまで書いたなと感心します。原書の副題”A Scientist Presents Evidence for Belief”がこの章でいきています。＜神＞について考えるというよりやっぱり＜信仰＞について書かれているのだと思います。神を＜信じる＞ことと科学者であるということにどう整合性が着くかこれがこの本の主題だと思います。

解説書として読むのなら

第III部の

第７から第10章を読めばだいたい事足ります。だいたい以下の４つに分類できるということです。

1. 無神論と不可知論
2. 創造論
3. インテリジェントデザイン
4. バイオロゴス（参照）

コリンズ氏の立場は＃４です。

有神論的進化論(Theistic Evolution, EV)でありかれがバイオロゴスと呼ぶ考え方です。名前はいかめしいですがそう複雑な概念ではありません。

ぼくには1と2の違いは如実だと思いますが、１と3,4の差は実はぼくにはピンときません。

翻訳も悪くないと思います。

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文庫本になった“容疑者Xの献身 (文春文庫 ひ 13-7)” (東野 圭吾)を読んでいました。特に難しいミステリーではなく途中でトリックの大枠はわかってしまいしました。映画でも何度も何度も謎解きのヒントが出てきます。

映画としてはとてもよくできていて楽しめました。時間さえ見つかればぜひご覧ください。

小説の中でも映画でも出てくるエピソードに数学の問題としての四色問題の証明の美しさということが有ります。数学の証明に美しいかどうかということがあることは何となく納得できます。

果たして生物学の論文にも同じようなことがあるのでしょうか。特に美しい論文としてJacobとMonorのオペロンの論文が挙げられることがあります。しかし生物学の論文というのは論理的に厳密な証明が記述されている訳ではないので数学や理論物理学の論文とは同一には論じられません。それでもなおどうかということですがどうなのでしょうか。

例えばこの論文などはぼくには美しい論文と感じられます。

大胆な発想、openな思想に満ちている，と思います。

専門家でないのでこの論文の評価はよくわかりませんけど。

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明日余裕でポッチとできます。

ばくちの様なもので０円か500万かとか0円か1500万かといった感じが何とも言えませんね。

どうなるのでしょうか。自分では非の打ち所のない申請と思っても読んで評価する人はそう思わないかも知れないし…

とりあえずpublication list 3ページ分が査読付きの論文(しかも9 point font）で全部埋まれば採択されてもいいような気もしますというか採択してください。

ところで久々に読んだNature

これすごいですね

http://www.nature.com/nature/journal/v455/n7216/fp/nature07378_ja.html

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岩波書店の雑誌『科学』に連載した「科学の種をまく」を加筆修正の上で再録したもの

です。

一言で言うとサイエンスコミュニケーションについて書かれた本です。

ではサイエンスコミュニケーションってなんだというと

科学コミュニケーション〜科学を伝える人たち

を読むとよく解ります。

ぼくはサイエンスもコミュニケータ失格だ。

単行本になっているだけあっていろんなお楽しみネタが満載で読んでいて楽しいことは事実です。

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