元日ですが普通の休日となんら変わりのない風景でした。太陽が出ている限りは穏やかな午後でした。

スターバックスもいつも通り満員でした。ネットもつながるし pocketWiFi忘れても問題なし。１時間ほど集中すると結構進みます。

昨年からnew year’s resolutionなどを書き付けることは止めました。

年末にイシューからはじめよ―知的生産の「シンプルな本質」を読みました。

書いてあることがいちいち納得できるものでした。

というよりissue drivenはぼくの方法論です。

生産性（＝成果/投下した労力ｘ時間　または成果/使った研究費）は高い方ではないかとあくまで密かに自負しています。

でかい成果が出ないのはこれは仕方ないです。こんなのは運もあります。しじたばたしても仕方ありません。過去の経験では、続けていたらそのうちドンと出ますよ、きっと。麻酔科領域内での評価などもほとんど関係ありませんしね。

どんな小さな論文でもissueというか解くべき課題を設定してそれを解決することを目標に研究を進めています。問題を設定してそれを解くという営みからは十分な知的満足を得ることができます。

研究室と言ってもぼくを含めて５人のグループで学生はぼくにとっては十分に優秀です。

このように基礎研究では”issue driven”な方法論はよくworkすると思います。

問題は研究費です。これが無いと本当に何もできません。集めるはそれなりに大変ですがそれはそれで何とかなっているので今までやってこれたのだと思います。

問題は、臨床の現場のマネージメントです。

麻酔をすること自体は簡単では無いにせよ始まれば知恵を絞ってやり遂げないわけにはいきません。時間は一方向にしか過ぎていきませんので長くとも２４時間ほど踏ん張ればたいていの手術は終わってしまします。

ぼくの職場の一つは手術室が６つの小さなユニットですが麻酔科医は９人くらいの先生に関与してもらっているし看護師さんも２０人ほど働いています。他科の先生も多数出入りします。

5人の研究グループをまとめるのとは違いこれをまとめるのは大変です。目標をどう設定するからして難問です。すでに手術数は施設の規模から判断して飽和しています。あとは質をどう高めるかなのですがこれが難しいのです。

もう一つの手術室の方ではこれから５年くらいの基礎作りが今年できるかどうかこれが一番大きな課題です。今年でできなければ来年までかかってもやり遂げる必要があります。

ここらへんが今年の目標です。

ケーブルテレビで

突入せよ!_あさま山荘事件
と
OPV
見ました。

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夏のツイ呑み会しますか梅雨が開けたら　今日もらったビラ中央の机に置いておきました。「欲張りプラン」で4200円。　

オフ会というのかなんというのかそこではアカウント名でお互いを呼んだりしてすこし不気味な会になるなたぶん。

”タロちゃん”とか”コロスケ”とかdeepが呼んでいたりして…やっぱりかなり不気味だね。

少し前に興味深い論文があったのですがしっかり読んでいませんでした。

この分野に素人のぼくには結構難解で多分この論文の論点を十分は理解していないと思うのですが、ハイポキシア生物学として読んでも得ることろはたくさんあると思いました。

Cellからです。

Derivation of Pre-X Inactivation Human Embryonic Stem Cells under Physiological Oxygen Concentrations

Cell, Volume 141, Issue 5, 872-883, 13 May 2010 

生理的な酸素濃度下で培養することによって、X染色体不活化前のマウスES細胞様のヒトES細胞を樹立したという論文です。

IVF由来8細胞期胚を融解して5% O2下で胚盤胞期まで発生させ、生理的な酸素濃度（〜5%, pO2, 36mmHg）および従来の大気中の酸素濃度（〜20%, pO2, 142mmHg）の培養条件下でヒトES細胞の樹立をそれぞれ三つと一つ樹立した。

5% O2条件下で樹立した細胞株を20%O2条件下で培養して遺伝子発現の変化を網羅的に検索したことろHIF pathwayにのっている遺伝子は軒並み発現抑制されたがさらに慢性的に20%O2環境に暴露すると多くの遺伝子の発現は 5%O2条件下のベースライン状態に戻った。20% O2曝露後でも発現変化を維持している遺伝子も198個同定された。OCT4, SOX2, NANOGなどのコア多能性遺伝子の発現には有意な変化は認められなかったのですが、神経外胚葉、栄養外胚葉、中胚葉、胚体外内胚葉、臓側内胚葉遺伝子が、20% O2曝露後に誘導された。つまり、20% O2曝露は、多能性を有意に損なうことはないが、一部の細胞の分化を促進するのだろう (This suggests that the exposure to 20% O2 does not significantly compromise pluripotency but may promote differentiation in a fraction of the cells)。

ここら辺から難しいのですが、女性細胞株におけるX染色体不活化（XCI）の状態を酸素分圧と酸化ストレスなどど絡めての解析が進みます。20%O2で培養するか5%O2条件下で培養するかでXIST遺伝子発現が異なり例えばヒトES細胞において不可逆的なXCIを起こすのには大気中O2曝露で十分である。抗酸化剤処理培養実験によって、酸化ストレスの阻害することが、大気中のO2曝露後の早発性XCIからヒトES細胞を救うことが示された。

5%O2環境が生体内で果たす重要性がES細胞にすごい重要な意味を持っていることがよくわかります。

5%O2環境はとても微妙な条件です。例えば、Chuvash型の VHL mutationなどはここらへんの酸素分圧で重要な意味合いを持つのかもしれません。またこのような過程に細胞内の代謝を絡めていくともっと面白い解析ができるかもしれません。

PLoS Geneticsに

Drosophila Genome-Wide RNAi Screen Identifies Multiple Regulators of HIF–Dependent Transcription in Hypoxia

PLoS Genet 6(6): e1000994. doi:10.1371/journal.pgen.1000994

という論文がありました。

かなり示唆的ですこし詳しく読んでみようと思います。

読売新聞でいきなり「メイスン＆ディクスン」の書評が登場していました「独立前夜　アメリカ膝栗毛」。これは面白いですよ。今「上」の1/3くらいまで進んでいます。

先生とわたし が新潮文庫で出ていました。これは身につまされる本ですね。とにかく読んでみたら良いと思います。たったの500円で世の中の見方が変わるよ。

iPhoneって組み立てには＄6.54しかかかっていないそうです。（参照）

New York Times から引用

ひとで不足でこんな感じで工場ではたらく人を集めているようです。すごいね。

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エントリー医学部の学費は値上げすべきだ読みました。

最近奨学金を出して田舎に医者を縛り付けようという制度がそこここで始まっていますが、こんな感じのローンが一般的になってくれば一括返済ではいさようならということも可能ですよね。医学生でなくリアルに医者になった人に 3000万くらい貸しつけて焦げ付くことはないのだから。

しかしこの制度30年前にあったとしてうちの親は踏み切れなかっただろうな。そもそもぼくを大学にやるという発想が無かった人たちですから。

結局6年で大学に払った学費は 150万円くらいだったような。研究を始めて一年で元を取りました。

結局”走ることについて語るときに僕の語ること (文春文庫)”も買いました。アパートに置いておく分です。



しかし気分が晴れないな。なんであんなことするのだろう、理解できません。

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リハビリの夜 (シリーズケアをひらく)

毎週頼んでもいないのに送ってくる「医学界新聞」というすごい名前の新聞で紹介されていたのがきっかけで読むことにしました。

著者は脳性麻痺の医者。東大の医学部を出て小児科の医者を経て現在は東大の先端科学技術研究センターで研究をされていると奥付けには書かれています。

著者の熊谷さんは、自力で歩くことはできないし特別に設計されたトイレでなければ用を足すことも自力では難しいという障害を生まれながらに持っていて幼少期からリハビリに明け暮れていた。その体験を元にした身体論なのだろうがぼくには一種の人生論としても読めた。

リハビリ体験が赤裸々に語られこの部分は第三章「リハビリの夜」と第四章「耽る」でセクシュアリティ論的に語られる。この部分を取り上げることはできると思うがぼくがびっくりしたのはその後。

そこから出発して著者が小児科医として勤務してからの体験が語られる第五章「動きの誕生」はこの本の白眉である。
極めて興味深い身体論が語られる。この部分だけでもすべての医療人とりわけ今年スタートして未だ医療現場に馴染めずプライドをずたずたにされている研修医に読んでもらいたいと思う。随分楽になるし絶対に”気付き”がある。
「身体内協応構造」のゆえ健常者でも緊張してしまい満足にV-lineを確保できない場合がある。それが「身体外協応構造」を手助けにいつの間にか難なくその作業をこなせるようになる。このプロセスが感動的に語られる。身体的な障害の有無に関わらない。
これは別に医療現場で苦戦している研修医だけでなく、医療経験を重ねた上に新しく基礎研究を始めたばかりの新米大学院生にも本気で読めば捕まえることのできる点がかならずある。

奇書という言い方は失礼かもしれないが、医学部の教科書にしても良いと思うほど影響を受ける本であることは保証する。
呑気に1Q84など読んでいる場合ではないし、ハンドブック型のマニュアル本を買うお金があればこの本を本気で読み込んだ方がいいと思う。

個人的には「敗北の官能」という言葉で著者が表現する「快楽」の一形態はとても興味深い。ぼくなど常に”負け”続けてきたので”負ける”ことにある種の快楽を見出すようになってきていると思う。
ここら辺はこれまた第六章「隙間に「自由」宿る」でうまい具合に表現されていて本当に参りました。この辺についてはまた書こうと思います。

妙な雰囲気の挿絵がまたよろしいですね。

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これは必読だよ。

まず第I章と第VI章を熟読して付録の代替医療便覧を読むとよい。

ホメオパシーは論外としても鍼も俎上に上がっています。

酸素療法などもなにげにバッサリとやられていますね。

療法はとにかく効けば良いのですが実際は効きもしないのに効くかもとかいわれても困るわけです。

漢方などもしっかりとRTCしてみたらいかがでしょうか。

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システムバイオロジー (現代生物科学入門 第8巻)

岩波書店の現代生物学入門シリーズの一冊ですー他は読んでいません-

序文にも書いてある様に一口にシステムバイオロジー-英語ではsystems biology-といってもシステムをどう考えるかでいろんな切り口が考えられます。

細胞だってシステムだろうし、臓器、個体はシステムである。循環器系とか神経系とかいうククリもある。公衆衛生的にはヒトの集団も立派なシステムだ。

この本の守備範囲は細胞以上個体未満である。

4章立てでそれぞれ一章から順に”反応拡散系による位置情報の形成”（近藤滋氏）、”生命システムの設計原理としてのシステムバイオロジー”（北野宏明氏）、”複雑系生物学――ゆらぎ，安定性，可塑性と適応，進化，発生”（金子邦彦氏）、”生命現象の動的特性――生化学反応ネットワークの安定性と振動”（黒田真也氏）が続く構成になっている。

第一章を読んでさっそく目からウロコがとれて第三章、第四章はと進み自分なりのイメージが形成されたような気がします。数式が出てくるのだがあまり気にならない。ーでもやっぱり読者を想定すれば極力数式をなくする努力はしてもらいたかったー
やっぱり生命とは何か―複雑系生命論序説
は難しいですよ。

第二章はよくまとまっているが同じ考えは他の出版物でも繰り返し記述されているので特別に新鮮味はなかった。蝶ネクタイ型構造に似ても同じ。

でもはじめて読む人にはすごくわかりやすい総説になっていると思います。

途中にHIFの記述がある。

わざわざ”HIF-1aの活性化”と書いてあるのだがHIF-1の活性化と分けてどういうふうに活性化を検出するのでしょうかね。もしかしたら蛋白質の細胞内蓄積量の増加を”活性化”と呼んでいるのでしょうかーまさかとは思うのですがー

ここら辺はぼくにはよく解りませんでした。

また取り上げられている”現象”(63ページ)って証明されたことがあるのでしょうか。この論文をクリアに証明した論文があれば示してもらうと助かったのに。こんな話もあるのでここで紹介されている”現象”はすこし単純化されすぎているような気もします。

メタボロームとか時計の話しがあればさらに良かった。

値段が高いですよね。仕方ないかバカ売れするとは思えないし。でも一押しです。

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今日から使い始めていますが快適です。

エアコンのスイッチを切っても部屋が寒くなっていきません。エアコンの音がしないのですごく静かです。これは良い買い物をしました。

日本掲載新聞の書評欄でCarl　Zimmerの”Microcosm: E. coli and the New Science of Life“の翻訳が出版されていることを知りました。
大腸菌　〜進化のカギを握るミクロな生命体というタイトルですが、うまく考えられたタイトルで原書のタイトルより優れているかもしれません。コチラのほうが本書のperspectiveをよく表しています。
ぼくは翻訳版を読んでいませんが、この本は推薦します。
原書はKindle版も出ています。
ぼくが持っているのはPANTHEONという出版社のversionですが、”Minion”というfontで印刷されています。とても美しいfontです。今調べるとぼくのMACにもinstallされていました。

Genome-wide identification of hypoxia-inducible fac tor binding sites and target genes by a probabilistic model integrating transcription-profiling data and in silico binding site prediction.

Nucleic Acids Res. 2010 Jan 8. [Epub ahead of print]

Mild hypoxia enhances proliferation and multipotency of human neural stem cells.

PLoS One. 2010 Jan 5;5(1):e8575.

A yeast two-hybrid system reconstituting substrate recognition of the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein

Nucleic Acids Res. 2007 December; 35(21): e142.

これって本当にworkするのかな。ちょっとびっくり。

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研究室がどんどん冷えてきています。

”今週の一押し”の解説を久々にちょっとしてみました(参照）。

New York Timesのこの記事には驚きました。とうとうここまで来たのですね。

Harvard Teaching Hospitals Cap Outside Pay

そうそうruna123がついにiPhoneゲットだそうです。きっと「おゆるし」がでたのでしょう。

最近”i手帳”使い込んでいます。

今週の一押し:2010-#01″The Checklist Manifesto: How to Get Things Right”

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研究室からの風景ですが、妙にどんよりとした一日でした。一歩も外出していませんが雨は降っていなかったようです。

今まで緊急手術はなく朝からコンピュータの前で集中できたので午後二時頃には目的の地点まで進み別の仕事にも着手できました。
ここ二週間くらいの懸案が解決の見込みがついたのですがこれを終えて一番大切な仕事にかかりたいと思っています。

本を読む余裕がなかったのですが昨日河原町のbook1stで二冊も買ってしまいました。

一冊目

ビヨンド・エジソン―12人の博士が見つめる未来

最相葉月さんの新作です。

12人の科学者へのインタビューを核にふくらませた本でこの手法自体は最相さんの”おはこ”と言えると思います。

以前に
いのち 生命科学に言葉はあるか (文春新書)
を読んで問題のとらえ方が自然で感心しました。

今回のものも12人の科学者の人選が絶妙なのだと思います。
一言で言うと”しぶい”人選なのです。

目次だけあげてみます

第一章　日本生まれの薬でアフリカ睡眠病に挑む
　寄生虫学者・北潔と医師シュバイツァー伝

第二章　恐竜少女が首長竜の新種と出会う
　古生物学者・佐藤たまきと数学者・藤原正彦の青春記

第三章　世界の乾燥地で植物生産の向上を目指す
　農業気象学者・坪充と反アパルトヘイト運動の闘士ネルソン・マンデラ伝

第四章　地震国日本から世界に発信する
　地震学者・石田瑞穂と国語学者・大槻文彦伝

第五章　南極の「空気の化石」に地球の歴史を見る
　物理学者・深澤倫子と雪博士・中谷宇吉郎の研究生活

第六章　言葉の不思議を探究する
　音声工学者・峯松信明と動物科学者テンプル・グランディンの自閉症報告

第七章　ウイルス感染症のメカニズムに迫る
　ウイルス学者・甲斐知恵子と物理学者マリー・キュリー伝

第八章　「空飛ぶ化学工場」黄砂を日本と中国で観測する
　物理学者・岩坂泰信と探検家・大谷光瑞伝

第九章　人間とコンピュータの対話をデザインする
　情報科学者・中小路久美代と作曲家モーツァルト伝

第一〇章　顕微鏡を覗いて生命の本質を探究する
　生物物理学者・徳永万喜洋と発明家トーマス・エジソン伝

第一一章　地球から宇宙船を操縦する
　宇宙科学者・矢野創と宇宙飛行士エリスン・オニヅカ伝

第一二章　アルツハイマー病の解明に挑む
　脳神経科学者・星美奈子と霊長類学者ジェーン・グドール伝

もう一冊は

医療崩壊の真実 (アスキー新書)

立ち読みで大方内容はつかんだのですが結局買いました。

第１章 　なぜ年収３０００万でも医者は去るのか？

第２章　“聖職”ではやっていけない——医者という孤独な職業

第３章　“儲からない”のが当たり前？——病院という不自由なビジネス

第４章　医療は”当然のサービス“？——患者も行政も意識を変える時期

終章　 “良い医療”をどう実現するか

多分大方の医者の意見を代弁している内容です。
世の中の医療を受ける人が一人でもおおくこの本を読んでくれると良いと思います

第3章に”手術室の稼働率が病院の利益を決める”という項目があります。というわけで麻酔科医ももっと大切にして下さい。

ある原稿の作業をしていて以下の総説を読みました。
ぼくが書こうと思っていたことが書かれいてびっくりしました。引用して一部羽来ることにしました。

Oxygen sensors in context

Biochimica et Biophysica Acta 1777 (2008) 1–14
10.1016/j.bbabio.2007.10.010

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