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夏のツイ呑み会

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研究室の全員がtwitterにアカウントを持つようになりました。

夏のツイ呑み会しますか梅雨が開けたら 今日もらったビラ中央の机に置いておきました。「欲張りプラン」で4200円。 

オフ会というのかなんというのかそこではアカウント名でお互いを呼んだりしてすこし不気味な会になるなたぶん。

”タロちゃん”とか”コロスケ”とかdeepが呼んでいたりして…やっぱりかなり不気味だね。

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少し前に興味深い論文があったのですがしっかり読んでいませんでした。

この分野に素人のぼくには結構難解で多分この論文の論点を十分は理解していないと思うのですが、ハイポキシア生物学として読んでも得ることろはたくさんあると思いました。

Cellからです。

Derivation of Pre-X Inactivation Human Embryonic Stem Cells under Physiological Oxygen Concentrations

Cell, Volume 141, Issue 5, 872-883, 13 May 2010 

生理的な酸素濃度下で培養することによって、X染色体不活化前のマウスES細胞様のヒトES細胞を樹立したという論文です。

IVF由来8細胞期胚を融解して5% O2下で胚盤胞期まで発生させ、生理的な酸素濃度(〜5%, pO2, 36mmHg)および従来の大気中の酸素濃度(〜20%, pO2, 142mmHg)の培養条件下でヒトES細胞の樹立をそれぞれ三つと一つ樹立した。

5% O2条件下で樹立した細胞株を20%O2条件下で培養して遺伝子発現の変化を網羅的に検索したことろHIF pathwayにのっている遺伝子は軒並み発現抑制されたがさらに慢性的に20%O2環境に暴露すると多くの遺伝子の発現は 5%O2条件下のベースライン状態に戻った。20% O2曝露後でも発現変化を維持している遺伝子も198個同定された。OCT4, SOX2, NANOGなどのコア多能性遺伝子の発現には有意な変化は認められなかったのですが、神経外胚葉、栄養外胚葉、中胚葉、胚体外内胚葉、臓側内胚葉遺伝子が、20% O2曝露後に誘導された。つまり、20% O2曝露は、多能性を有意に損なうことはないが、一部の細胞の分化を促進するのだろう (This suggests that the exposure to 20% O2 does not significantly compromise pluripotency but may promote differentiation in a fraction of the cells)。

ここら辺から難しいのですが、女性細胞株におけるX染色体不活化(XCI)の状態を酸素分圧と酸化ストレスなどど絡めての解析が進みます。20%O2で培養するか5%O2条件下で培養するかでXIST遺伝子発現が異なり例えばヒトES細胞において不可逆的なXCIを起こすのには大気中O2曝露で十分である。抗酸化剤処理培養実験によって、酸化ストレスの阻害することが、大気中のO2曝露後の早発性XCIからヒトES細胞を救うことが示された。

5%O2環境が生体内で果たす重要性がES細胞にすごい重要な意味を持っていることがよくわかります。

5%O2環境はとても微妙な条件です。例えば、Chuvash型の VHL mutationなどはここらへんの酸素分圧で重要な意味合いを持つのかもしれません。またこのような過程に細胞内の代謝を絡めていくともっと面白い解析ができるかもしれません。

PLoS Geneticsに

Drosophila Genome-Wide RNAi Screen Identifies Multiple Regulators of HIF–Dependent Transcription in Hypoxia

PLoS Genet 6(6): e1000994. doi:10.1371/journal.pgen.1000994

という論文がありました。

かなり示唆的ですこし詳しく読んでみようと思います。

読売新聞でいきなり「メイスン&ディクスン」の書評が登場していました「独立前夜 アメリカ膝栗毛」。これは面白いですよ。今「上」の1/3くらいまで進んでいます。

先生とわたし が新潮文庫で出ていました。これは身につまされる本ですね。とにかく読んでみたら良いと思います。たったの500円で世の中の見方が変わるよ。

iPhoneって組み立てには$6.54しかかかっていないそうです。(参照

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New York Times から引用

ひとで不足でこんな感じで工場ではたらく人を集めているようです。すごいね。

Written by bodyhacker

7月 6th, 2010 at 10:18 pm

カンテツ

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昨晩の当直はまたまたカンテツするはめになりました。

2時くらいからしんどくなり4時半くらいまで苦しくなんにも記憶に残っていないのですが峠を越えるといつものNatural High状態となり当直メイトのK本先生(四月から一緒に研究をする)とふたり旅でICUへ患者を届けたのが6時10分。結局寝そびれてづっと起きています。脳細胞は一億個くらい死んでいると思います。
月にカンテツ二回はキツイは、やっぱり。

HIF-1alpha signaling is augmented during intermittent hypoxia by induction of the Nrf2 pathway in NOX1-expressing adenocarcinoma A549 cells.

Free Radic Biol Med. 2010 Mar 24. [Epub ahead of print]

ぼくの縁の分子がどんどん登場。

Hypoxia-Inducible Factor Prolyl-Hydroxylase 2 Senses High-Salt Intake to Increase Hypoxia Inducible Factor 1{alpha} Levels in the Renal Medulla.

Hypertension. 2010 Mar 22. [Epub ahead of print]

ちょっと先を越されたかも。

最期はPNASから
Disruption of the right temporoparietal junction with transcranial magnetic stimulation reduces the role of beliefs in moral judgments

PNAS March 29, 2010, doi: 10.1073/pnas.0914826107

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下流の宴を読みました。
毎日新聞に連載された小説。

二つの全く異なる家庭で育ったカップルを軸にその家族が絡んでいく小説です。

妙にリアルなのは、主要な登場人物の一人の珠緒(整形手術の必要のある顔をもち沖縄の高校を状況しもう一人の登場人物 翔と同棲をしている)が、ゲイの美容整形グループのオーナとかの援助の元に宮崎大学の医学部に合格する話しのスジです。大学受験を一回も経験していない珠緒にとって最も可能性があるのが宮崎大学の医学部というわけです。たぶん受験関係者の中では当たり前くらいの常識なのでしょうが妙にアリルです。

このリアルさゆえにかなりデフォルメされたキャラが生きてくるのだろうな。

この小説、最後に至ってもだれが正しいのか勝者なのか分からないのです。

医学部に合格してしまう珠緒にしても結局この受験により翔と別れることになりこれが幸せなのかは解からんな、実際。

ゲイの美容整形グループのオーナも東大の医学部を出て大儲けしていても結局若い恋人には逃げられっぱなしだし。

せっかく京大での外資系投資ディーラーと肉弾戦を勝ち抜き結婚した可奈にしてもあっけなく子連れで出戻りとなってしまった。
強いていうと翔くんの勝ちということになるのだろうか。珠緒の生き方が突破口だとはぼくは思わない。

下流の宴

Written by bodyhacker

3月 30th, 2010 at 9:05 pm

molecular-gastronomy

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Natureで法医学の特集をやっていました。
Science in court
結局全部読んでしまいましたがなかなかタメになりました。
進んでいるようでまだまだなのですね。

RAF inhibitors transactivate RAF dimers and ERK signalling in cells with wild-type BRAF
RAF inhibitors prime wild-type RAF to activate the MAPK pathway and enhance growth
にCellの
Kinase-Dead BRAF and Oncogenic RAS Cooperate to Drive Tumor Progression through CRAF
この三つの論文はかなりすごいのではないのでしょうか。度肝を抜かれました。こんなことがありるのですね。これはすごいです。

最後もNatureからです。
molecular-gastronomyという研究分野があり、その大御所Dr.Hervé Thisへのインタビューが載っていました。

Why do some meals taste better than others?

The principles of cuisine are love, art and technique: perfect technique without love and companionship is lost. A poor sandwich shared with good friends will taste better than dinner in a three-star Michelin restaurant shared by an arguing couple. Primates generally avoid bitter tastes such as beer. But the sensory punishment of drinking bitter beer is more than offset by the social reward of being in a group.

Are any foods poor candidates for molecular-gastronomy research?

I try not to work on cheese, wine, bread or sausages — the microbiology is too complicated. Onions and carrots are better subjects, but progress is slow. After two PhD projects studying the creation of carrot stock, we are only beginning to understand the molecular diffusion processes involved.

一問一答でこのようなやりとりが続きます。
すごく興味を持ったのでThe Science of the Oven (Arts and Traditions of the Table)を注文しました。

note-by-note cookingってどんな料理法なのだろうか

The Science of the Oven (Arts and Traditions of the Table)

Written by bodyhacker

3月 24th, 2010 at 10:41 pm

Posted in Thus Spoke Dr. Hypoxia

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