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いまだ出力できず

bodyhacker — Tue, 01 Sep 2009 14:45:19 +0000

プリンターへの出力は未だできず。

	Reactivating HIF prolyl hydroxylases under hypoxia results in metabolic catastrophe and cell death.
	Tennant DA, Frezza C, Mackenzie ED, Nguyen QD, Zheng L, Selak MA, Roberts DL, Dive C, Watson DG, Aboagye EO, Gottlieb E. Oncogene. 2009 Aug 31. [Epub ahead of print]

Hypoxia promotes expansion of the CD133-positive glioma stem cells through activation of HIF-1alpha.

Soeda A, Park M, Lee D, Mintz A, Androutsellis-Theotokis A, McKay RD, Engh J, Iwama T, Kunisada T, Kassam AB, Pollack IF, Park DM.
Oncogene. 2009 Aug 31. [Epub ahead of print]

続々でるな。

今週一番感動したのは以下の論文

Riboflavin kinase is shown to couple TNF receptor 1 to reactive oxygen production by the FAD-dependent NADPH oxidase.

Benjamin Yazdanpanah, Katja Wiegmann, Vladimir Tchikov, Oleg Krut, Carola Pongratz, Michael Schramm, Andre Kleinridders, Thomas Wunderlich, Hamid Kashkar, Olaf Utermöhlen, Jens C. Brüning, Stefan Schütze & Martin Krönke

doi:10.1038/nature08206

ここで解析されている現象の分子機序はぼくがredox研究を始めたときから知りたいと思っていたことです。その意味で感慨深い。

しかしこれが正しいとするとぼくの仮説（論文にも書いたことがある）が一応否定されたことになるのだが…

例えばここにAsk1とかどう絡んでくるの？　と考えればいくつかの実験が思いつきますが今のぼくにはできないな。

#13-01 多難な船出出しました

昨日の夜はなぜか精神的にてんぱっていたのですが、冷静に考えればそう大騒ぎすることもなく今日はfigureを作る作業が90%終了。本体の作業も今週中には終わるよ。

NYTから

Finding a Scapegoat When Epidemics Strike

これはおもしろかった

The most visible aspect of blame, of course, is what name a disease gets. The World Health Organization has struggled mightily to avoid the ethnic monikers given the Spanish, Hong Kong and Asian flus, instructing its representatives to shift from “swine flu” to “H1N1” to “A (H1N1) S-O.I.V.” (the last four initials stand for “swine-origin influenza virus”) to, recently, “Pandemic (H1N1) 2009.”

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コロンブスの卵だから秘密

bodyhacker — Mon, 27 Apr 2009 13:28:47 +0000

大阪のOさんからのmailに書かれていた疑問はまさにコロンブスの卵というようなものだ。

言われると思い当たる節がありまくりです。というかこれは”あり”ですよ。

とにかく証明されたらかなり大きな話になると思います。他人にどう信じてもらうかが鍵ですよね。

内容は秘密です、コロンブスの卵だから。

土曜日に自宅最寄り書店でMichael Chabonの“The Yiddish Policemen’s Union (P.S.)” の翻訳“ユダヤ警官同盟 ” (マイケル・シェイボン)上・下巻を発見。とりあえず半分読了。

これが新潮文庫から出るのだからすごいですよ。

Michael Chabonはぼくが米国に滞在中に”The Amazing Adventures of Kavalier & Clay”がバカ売れしていて早速買って読み始めたのですが途中で挫折。結局、“カヴァリエ&クレイの驚くべき冒険” を買って読了しました。彼の英語は難しすぎてぼくの能力を超えています。なので翻訳がどれくらいよいのかわからないのですが翻訳がおもしろいことは請け合います。

今日NYTに出てました。

米国でもやっぱ医者不足。

Shortage of Doctors Proves Obstacle to Obama Goals

映画二本観ました。

なぜか家内と。映画を観ている最中に話しかけるのは止めてください。

トウキョウソナタ

井川遥がやっていたピアノの先生って何だったのでしょうか。それがよくわらんかった。

櫻の園

だいぶん翻案されていました。最後のスピッツの歌が妙に耳に残ってiTSで買ってしまいました。

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麻酔と意識

bodyhacker — Mon, 10 Nov 2008 13:13:54 +0000

今日気付いたのですが最新号のScienceに

Consciousness and Anesthesia

と題するreviewが掲載されています。

いろいろと書いてある割には渡り障りのない結論のような気もしますが読んだらためになると思います。

table1の絵はおもしろいです。今度使おう。

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今週の一押し:2008-#31:”ゲノムと聖書”

bodyhacker — Mon, 03 Nov 2008 08:10:04 +0000

“ゲノムと聖書:科学者、〈神〉について考える” (フランシス・コリンズ)

The Language of God: A Scientist Presents Evidence for Belief

J. Watsonの後を襲って米国のヒューマンゲノムプロジェクトを率いたFrancis Collins (参照)の著作の翻訳です。

科学者とくに生命科学者であることとキリスト教の信者（コリンズ氏は、only nominally Christianである両親に育てられ若いころはatheist-無神論者-であったが医学部で学ぶ過程で福音主義キリスト教徒となった）であることが両立するのかという問題が論じられます。

コリンズ氏のあまりに率直な書き方にひどく驚きましたが、ドーキンスの『神は妄想である-宗教との決別』やグールドの『神と科学は共存できるか？』よりは親密な感情を抱きながら読み進めることができました。

圧巻は第11章「真理の探求者たち」だと思います。よくここまで書いたなと感心します。原書の副題”A Scientist Presents Evidence for Belief”がこの章でいきています。＜神＞について考えるというよりやっぱり＜信仰＞について書かれているのだと思います。神を＜信じる＞ことと科学者であるということにどう整合性が着くかこれがこの本の主題だと思います。

解説書として読むのなら

第III部の

第７から第10章を読めばだいたい事足ります。だいたい以下の４つに分類できるということです。

無神論と不可知論
創造論
インテリジェントデザイン
バイオロゴス（参照）

コリンズ氏の立場は＃４です。

有神論的進化論(Theistic Evolution, EV)でありかれがバイオロゴスと呼ぶ考え方です。名前はいかめしいですがそう複雑な概念ではありません。

ぼくには1と2の違いは如実だと思いますが、１と3,4の差は実はぼくにはピンときません。

翻訳も悪くないと思います。

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科学における”仮説”

bodyhacker — Tue, 16 Sep 2008 12:49:15 +0000

Cellからです。

A Brief History of the Hypothesis

科学における”仮説”の歴史を概説したものです。

”論理実証主義”的な科学のとらえ方には古来多くの疑問が呈されてきたということの解説です。

ガリレオ、ベーコンと進んできてニュートンの”I frame no hypothesis”という言葉で代表される仮説の定立によらない帰納法的な方法論、ヒュームの懐疑論、ポパーの反証主義が解説され最後にラッセル、クーンの考え方が紹介されていきます。最後に反証主義が医学となじむかというような議論が行われています。

医学を”科学”だと考えて、医療の世界で反証主義を追及していったら療法を実際に患者に適応できなくなってしまいます。100％の完全な療法は存在せずある療法を施しても治癒できない疾患は存在します。例えばstatinが心血管系の疾病の発症を予防する作用を持つというclinical trialが成立したとしてもある特定の個人でstatinがまったく効かない場合が一例でもあればstatinの臨床使用が合理化されないとしたら製薬会社は成り立ちません。

このような場合、遺伝子を調べるとstatinの感受性を説明できる変化が見いだされそれによりstatinが効く人と効かない人を区別でき、特定の集団にだけstatinを使用すればいいということになりますがこれは一種のアドホックな仮説の援用とも言えます。悪く言えばその場しのぎの言い訳なのですがよく言えば、tailored medicineということになります。だからといっていろんな例外つまり反証は存在します。

このため医学は科学でなく芸術なのだという言い方をする人もあります。

多分このような問題は科学より大きな知識というような考え方を導入するする必要があると思います。

実はこの論文に書いてあるようなことは

“99・9%は仮説思いこみで判断しないための考え方” (竹内薫)

ですべて解説されています。この本は話し言葉で記述されていて実際　iTune Storeでこの本の朗読版を購入することもできます。歩きながら本が”読めて”しまうわけです。

上記の論文の著者の一人David J. Glassの書いた本に

“Experimental Design for Biologists” (David J. Glass)

という本があります。結構おもしろい本です。

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