New York Timesを読んでいたら面白い記事というかエッセイを見つけました。
アメリカの元財務長官でハーバード大学の学長もしたサマーズ氏の”What You (Really) Need to Know“というタイトルです。
時代が変わっているのだから教育システムも変わる必要があるということを主張した文章です。
このエッセーを巡って紙上debate(“English Is Global, So Why Learn Arabic?“)も開催されています。

主張が箇条書きにされているのですが少し引用してみます。(ぼくが一部を太字にしました）

1. Education will be more about how to process and use information and less about imparting it. This is a consequence of both the proliferation of knowledge — and how much of it any student can truly absorb — and changes in technology.
2. An inevitable consequence of the knowledge explosion is that tasks will be carried out with far more collaboration. As just one example, the fraction of economics papers that are co-authored has more than doubled in the 30 years that I have been an economist.
3. New technologies will profoundly alter the way knowledge is conveyed. Electronic readers allow textbooks to be constantly revised, and to incorporate audio and visual effects.
4. As articulated by the Nobel Prize-winner Daniel Kahneman in “Thinking, Fast and Slow,” we understand the processes of human thought much better than we once did. We are not rational calculating machines but collections of modules, each programmed to be adroit at a particular set of tasks.
5. The world is much more open, and events abroad affect the lives of Americans more than ever before. This makes it essential that the educational experience breed cosmopolitanism — that students have international experiences, and classes in the social sciences draw on examples from around the world.
6. Courses of study will place much more emphasis on the analysis of data. Gen. George Marshall famously told a Princeton commencement audience that it was impossible to think seriously about the future of postwar Europe without giving close attention to Thucydides on the Peloponnesian War.

まあこれってよく言われることですよね。ちきりん氏の「自分のアタマで考えよう
」でも同じような主張はされています。でもサマーズ氏がこのようにまとめると権威あります。

このエッセーでサマーズ氏は

English’s emergence as the global language, along with the rapid progress in machine translation and the fragmentation of languages spoken around the world, make it less clear that the substantial investment necessary to speak a foreign tongue is universally worthwhile. While there is no gainsaying the insights that come from mastering a language, it will over time become less essential in doing business in Asia, treating patients in Africa or helping resolve conflicts in the Middle East.

と述べているのですがこの部分について紙上debateが行われています。

たぶん近い将来にに日本語をしゃべったり書いたりするそばから英語やフランス語に翻訳されていくシステムができると思います。
留学をしない，しなくてもよい理由をいくら並べてみても栓がありません。当たり前ですが英会話がうまくなるために留学するわけではありません。より広い視野を獲得するために留学するのですから。

Nature Cell Biologyに
The LIMD1 protein bridges an association between the prolyl hydroxylases and VHL to repress HIF-1 activity
Nature Cell Biology (2012) doi:10.1038/ncb2424
という論文が出ていました。これは面白いです。しかしこの論文はぼくらの2001年の論文の解析の途中でもある程度予想されていたような事象だと思います(参照-Web of Scienceの統計では507回引用されたようです。）。

今年も「キアドラ」が届きました。

医学界新聞を読んでいたら”Experimental Design for Biologists“の邦訳「バイオ研究のための実験デザイン -あなたの実験を成功に導くために」が出ているのを知りました。日本語は読んでいませんがよい本だと思います。

関連するエントリー:

• E.R. confusion
• 「基礎医学の教授に医師がいなくなってもいい」と思います
• SCImago Journal Rank
• 麻酔法なども特許になるのか？-ならない？
• あと一廻り早く生まれていたら…

昨年同様まず統計から。
pubmedを（HIF[TIAB] and 2011[DP]）で検索すると1291件と出ました。昨年が1136件でしたのでほぼ同じ勢いです。毎日3つ以上HIF関連の論文が出版されているのです。

また(hypoxia[TIAB] and 2011[DP])だと4652件。昨年が4167件でしたのでこちらはたぶん有意に増加ですね。

ちなみに(iPS[TIAB] and 2011[DP])は 598件ですし，(anesthesia[TIAB] or anesthesiology [TIAB]) and 2011[DP] は4679件です。

酸素がさまざまな生命現象に関わっているということがあるので酸素分圧感知機構-HIFの経路も様々な生命現象に関わっています。すでに2000年にはGLSによるこんな総説が出ているほどです。
そして今年はとうとうNEJMに
Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease

N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.

が掲載されました。快挙ですね。

昨年

来年はHIFの活性化機構を原理として利用する方法でない細胞内酸素分圧のimagingが可能になってくると思います。今年発表されたいくつかのprobeを使ったよい研究が出て来るのが楽しみです。

と書きました。

理想のプローブは今年も現れませんでしたが
Hypoxia-sensitive fluorescent probes for in vivo real-time fluorescence imaging of acute ischemia.

J Am Chem Soc. 2010 Nov 17;132(45):15846-8

で記述されているローブには興味を引かれました。
研究会でも直接お話しを伺うことができました。
腎臓は酸素消費量が多くHRE依存的な遺伝子発現が通常酸素分圧下で生きているマウスでも観察されます。このような領域を低酸素領域と呼ぶかどうかは別としてこの程度のHIFの活性化をある程度の線形性をもって表現できる低酸素プローブが開発されてリアルイメージングに応用できるとよいと思います。
ぼくのほしいプローブはこんなプローブです。よろしくお願いします。できたらはじめに使わせてください。

その他の低酸素プローブにはあまり興味をもてませんでした。

Natureに植物の低酸素応答に関する論文が二つback-to-backで出ていました。
Oxygen sensing in plants is mediated by an N-end rule pathway for protein destabilization

Nature. 2011 Oct 23;479(7373):419-22. doi: 10.1038/nature10536.

と
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants.

Nature. 2011 Oct 23;479(7373):415-8. doi: 10.1038/nature10534.

たぶんぼくは完全に理解はできないと思いましたがネタとしては知っておくのがよいと思ったので読んでみました。

TRPA1 underlies a sensing mechanism for O2.

Nat Chem Biol. 2011 Aug 28;7(10):701-11. doi: 10.1038/nchembio.640.

もよい論文です。TRP channelがサブタイプ特異的に環境の酸素分圧の上がり下がりをセンスしていてるということを示した論文です。この論文も著者の高橋さんにぼくらの勉強会でセミナーをしていただきいろんな話を聞けました。来年度やりたい人がいれば挑戦していただきたいとぼくは思っています。
今年も医科研の坂本先生のMint3ネタで論文が出ています。
Deletion of the Mint3/APBA3 gene in mice abrogates macrophage functions and increases resistance to lipopolysaccaride-induced septic shock.

J Biol Chem. 2011 Sep 16;286(37):32542-51.

Pyruvate kinase M2 is a PHD3-stimulated coactivator for hypoxia-inducible factor 1.

Cell. 2011 May 27;145(5):732-44.

MCM proteins are negative regulators of hypoxia-inducible factor 1.

Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):700-12.

Hypoxia. Cross talk between oxygen sensing and the cell cycle machinery.

Am J Physiol Cell Physiol. 2011 Sep;301(3):C550-2.

これらもよかったです。
GLS件はやはり一歩進んでいる感じがします。
以前といってもぼくが大学生の頃NHKのFM放送に作家の五木寛之が出演していて自分の立ち位置をトラック競技になぞらえて話していたことがあり今でも記憶に残っています。つまり自分は他のランナーの集団から少し先を走っているのであるがその少しはそのように見えるだけであって実はトラック一周先行した上での少し先なのだと。生命科学の世界でもそのような研究室ってありますよね。
そうそう
Control of T(H)17/T(reg) balance by hypoxia-inducible factor 1.

Cell. 2011 Sep 2;146(5):772-84.

これも印象的でした。先行論文があったのですがこっちはCellということで勢いの違いはあるのだと思います。

A HIF-1 target, ATIA, protects cells from apoptosis by modulating the mitochondrial thioredoxin,TRX2.

Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):597-609.

thioredoxin関連はいつも注目しています。

また腎臓のEPO産生細胞についての京大の柳田さん-御大ではありません。念のため。でも御大みたいなものかも-の研究室の
Dysfunction of fibroblasts of extrarenal origin underlies renal fibrosis and renal anemia in mice.

J Clin Invest. 2011 Oct 3;121(10):3981-90. doi: 10.1172/JCI57301

と
東北大学の山本先生のお部屋の鈴木さん方の
Isolation and characterization of renal erythropoietin-producing cells from genetically produced anemia mice.

PLoS One. 2011;6(10):e25839.

はすごいと思いました。

論文を読むとPapersで整理して☆をつけます。
最高が☆☆☆☆☆なわけですが，今日整理していて

Hypoxia increases transepithelial electrical conductance and reduces occludin at the plasmamembrane in alveolar epithelial cells via PKC-ζ and PP2A pathway.

Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2011 Apr;300(4):L569-78.

にも☆☆☆☆☆がつていました。
これ麻酔科医にとってはとても興味深い論文です。

低酸素関連で
Hypoxia and inflammation.

N Engl J Med. 2011 Feb 17;364(7):656-65.

Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease

N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.

の二篇NEJMに出たのには感動しました。
この世界Nature, Cellといっても十分でなくNEJMに総説として取り上げられてやっと一人前という世界ですから。

最後にぼくの研究室の論文を紹介してお終いにしたいと思います。
Hydrogen Sulfide Inhibits Hypoxia- But Not Anoxia-Induced Hypoxia-Inducible Factor 1 Activation in a von Hippel-Lindau- and Mitochondria-Dependent Manner

Antioxid Redox Signal. 2012 Feb 1;16(3):203-16. Epub 2011 Oct 17.

院生の甲斐さんの論文です。
これは結構引用される論文になると思います。

気がついた論文を列挙してみました。

今年☆☆☆☆☆をつけた論文が20篇ほどありました。☆☆☆☆で 10篇くらいです。ですので紹介したのはほんの一部です。

というわけで今年もこのブログ愛読ありがとうございました。
今の職場を辞めるまで続けると思います。

それでは皆さんよいお年をお迎えくださいませ。関連するエントリー:

• ハイポキシア生物学の2010年を振り返って
• 植物の低酸素応答の分子機構
• カンテツ
• ほんと困ったものです
• 寒い!

この論文では結構重要な事を主張しているとぼくらは思っているのですが解らない人には解らないようです。

PLoS ONEですから一旦出版されれば無料で読むことができます。

General anesthetics inhibit erythropoietin induction under hypoxic conditions in the mouse brain

Background: Erythropoietin (EPO), originally identified as a hematopoietic growth factor produced in the kidney and fetal liver, is also endogenously expressed in the central nervous system (CNS). EPO in the CNS, mainly produced in astrocytes, is induced under hypoxic conditions in a hypoxia-inducible factor (HIF)-dependent manner and plays a dominant role in neuroprotection and neurogenesis. We investigated the effect of general anesthetics on EPO expression in the mouse brain and primary cultured astrocytes.

Methodology/Principal findings: BALB/c mice were exposed to 10% oxygen with isoflurane at various concentrations (0.10-1.0%). Expression of EPO mRNA in the brain was studied, and the effects of sevoflurane, halothane, nitrous oxide, pentobarbital, ketamine, and propofol were investigated. In addition, expression of HIF- 2α protein was studied by immunoblotting. Hypoxia-induced EPO mRNA expression in the brain was significantly suppressed by isoflurane in a concentration-dependent manner. A similar effect was confirmed for all other general anesthetics. Hypoxia- inducible expression of HIF-2α protein was also significantly suppressed with isoflurane. In the experiments using primary cultured astrocytes, isoflurane, pentobarbital, and ketamine suppressed hypoxia-inducible expression of HIF-2α protein and EPO mRNA.

Conclusions/Significance: Taken together, our results indicate that general anesthetics suppress activation of HIF-2 and inhibit hypoxia-induced EPO upregulation in the mouse brain through a direct effect on astrocytes.

このシリーズはこれに続いて最低二報出すつもりです。

少し前に”Antioxidants & Redox Signaling”に甲斐先生の論文が出たのですが紹介していませんでした。

Hydrogen Sulfide inhibits hypoxia- but not Anoxia-induced hypoxia-inducible factor 1 activation in a von Hippel-Lindau- and mitochondria-dependent manner

Antioxidants & Redox Signaling

Abstract

Aims: In addition to nitric oxide and carbon monoxide, hydrogen sulfide (H(2)S) is an endogenously synthesized gaseous molecule that acts as an important signaling molecule in the living body. Transcription factor hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) is known to respond to intracellular reduced oxygen (O(2)) availability, which is regulated by an elaborate balance between O(2) supply and demand. However, the effect of H(2)S on HIF-1 activity under hypoxic conditions is largely unknown in mammalian cells. In this study, we tried to elucidate the effect of H(2)S on hypoxia-induced HIF-1 activation adopting cultured cells and mice.
Results: The H(2)S donors sodium hydrosulfide and sodium sulfide in pharmacological concentrations reversibly reduced cellular O(2) consumption and inhibited hypoxia- but not anoxia-induced HIF-1α protein accumulation and expression of genes downstream of HIF-1 in established cell lines. H(2)S did not affect HIF-1 activation induced by the HIF-α hydroxylases inhibitors desferrioxamine or CoCl(2). Experimental evidence adopting von Hippel-Lindau (VHL)- or mitochondria-deficient cells indicated that H(2)S did not affect neosynthesis of HIF-1α protein but destabilized HIF-1α in a VHL- and mitochondria-dependent manner. We also demonstrate that exogenously administered H(2)S inhibited HIF-1-dependent gene expression in mice.

Innovations: For the first time, we show that H(2)S modulates intracellular O(2) homeostasis and regulates activation of HIF-1 and the subsequent gene expression induced by hypoxia by using an in vitro system with established cell lines and an in vivo system in mice. Conclusions: We demonstrate that H(2)S inhibits hypoxia-induced HIF-1 activation in a VHL- and mitochondria-dependent manner.

硫化水素の低酸素応答への影響を調べました。島根医大の竹永先生から供与していただいた細胞が大活躍でした。
関連するエントリー:

• 論文通りました
• 論文がアクセプトされました
• 論文が通りました
• 論文が出ました
• 正式にaccept

HIFネタです。ホント最近すごいですよね。特に”Cell”系の雑誌でのHIFのモテ方は異常なくらいです。
ぼくが研究を始めた頃は年間の論文の数は20−30篇くらいで全然流行っていなかったのですよ。それが今や一日3篇から4篇は出版されるのですから…

Hypoxia-inducible factor 1-mediated human GATA1 induction promotes erythroid differentiation under hypoxic conditions.

J Cell Mol Med. 2011 Nov 3. doi: 10.1111/j.1582-4934.2011.01484.x.

これって結構重要な感じがします。だってGATA1とHIF-1ですよ。

Activation of the HIF Prolyl Hydroxylase by the Iron Chaperones PCBP1 and PCBP2

Cell Metabolism, Volume 14, Issue 5, 647-657,

これには驚きました。執念とも言えるかもしれません。

amazon.comに注文してた“1Q84”が今日到着しました。送料込みで＄21.52です。
Kindle版で読んだのですがやっぱり本がほしかったんです。

装丁がいいです。

よくある表紙の写真ですがカバーを外すと

こうなります。

後ろの表紙は

こうですがカバーを外すと

です。

青豆と天吾。

背表紙は

が

こうです。
表紙をめくると

月が二つの1Q84です。

ちなみに，使われているFONTは今回は”Minion”です。ぼくのMacには入っていました。

関連するエントリー:

• 今年最高と言い切ってしまいます
• 常識に挑戦している訳ではありません
• 疑問氷解または持つべきものはよい共同研究者
• Yahoo知恵袋の質問で今までの研究成果が試される，かも。
• 植物の低酸素応答の分子機構

Natureに植物の低酸素感知に関する論文が二つ出ています。
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants

Nature (2011) doi:10.1038/nature10534

Oxygen sensing in plants is mediated by an N-end rule pathway for protein destabilization

Nature (2011) doi:10.1038/nature10536

N-end ruleに従う蛋白質の分解が重要な鍵を握る所など似通ったところがあるというのが不思議です。
ちなみにこれらの論文で云うhypoxiaとはほぼanoxiaの条件です。

Steve Jobs氏の伝記が昨日発売になりました。
原書と邦訳の価格の差が酷いなどなにかと話題です。(参照）
確かにひどい商売です。
ぼくはナイーブに翻訳を注文したのですが全然発送されないので怒って注文をキャンセルしてKindle版を買いました。幸いぼくの手に負える英語ですのでこれで最後まで読もうと思います。

翻訳と云えばGroopmanの”Your Medical Mind: How to Decide What Is Right for You“の翻訳，「医者は現場でどう考えるか」）が出版されたようです。
よい本だと思います。
ついでに，最新作Your Medical Mind: How to Decide What Is Right for Youも出たようです。
ぼくはGawande氏よりGroopmanの方が知性的だと思います。

もう一冊
House and Psychology: Humanity Is Overratedは面白いです。あの”House“を心理学的に解剖した本です。テレビ番組を見たことのない人は楽しめないと思いますけど…

GLSの熱血解説に聞き入る院生達@Welch Library in JHU

二週間ほど遅れてiOS5にupgradeしました。確かに便利になっていると思います。なるべく早く”4S”にしたいと思います。

1Q84
は今現在まだぼくのKindleには流れてきていません。

来週の火曜日に大学院の入学試験があるようです。受からないことには始まりませんので時間まで答案用紙に向かってください。
関連するエントリー:

• ハイポキシア生物学の2011年を振り返って
• “The instruction we find in books is like fire”
• 「奪還」あるいは「粉々になった自我を拾い集める」試みを観て
• Kindleが
• Yahoo知恵袋の質問で今までの研究成果が試される，かも。

入道雲もむくむくと大きくなっていかないし，この蒸し暑つ感に何よりまだまだ梅雨であることを実感させられます。

論文のrevisionはほとんど終わっているのですがほんと”うじうじと”細かい字句を修正しています。
今日のような土曜日はこのような作業にはほんとありがたいです。PHSが一回も鳴りませんから。ぼくのPHSは電源を切らないことにしています。かかってきた電話の相手の履歴を残すためです。
査読について前回書きました。

End the wasteful tyranny of reviewer experiments
も参考になると思います。超一流雑誌でなくとも無理難題を査読者にふっかけられることはよくあります。
某臨床系学会の英文機関誌でもこれはよくあるのです。必ずしも敵対的な立場にある人がそう書くのでなく要するに実験をしたことが無い査読者がそう書くのです。この場合editorが裁定をする必要があると思いますが，大抵の場合査読者のコメントを妙に重視するので困ります。結局一回は世に出して，その上でその論文が”世間”にどうととらえられたかでその論文の評価をしていくしかないのだと思います。それには1年，3年もっと言えば5年くらいの時間がかかります。それ位の期間は仕方ありませんよ。

Cellに
Inheritance of Stress-Induced, ATF-2-Dependent Epigenetic Change

Cell, Volume 145, Issue 7, 1049-1061, 24 June 2011

がありました。ある種の”獲得形質”は遺伝するのが前提でその機序の一端を解明した論文ですよね。ATF-2にこだわり続けいてる石井先生の研究室の成果です。感動的ですらありますね，ストーリーが。

NEJMに
Conscious Sedation for Minor Procedures in Adults

N Engl J Med 2011; 364:e54June 23, 2011

が出ていました。主に，検査に際してのsedationについての総説です。
日帰り手術を含むこのような文脈では人工呼吸をすることを前提としたいわゆる”麻酔の常識”が成り立たない場合はいくらでもあります。
絶飲時間でも麻酔開始1時間としても何の問題もありません。手術が決まってから泥縄でする禁煙だってホントに効果があるのかはかなり怪しいと思います。

実際
Stopping Smoking Shortly Before Surgery and Postoperative Complications

この様なmeta-analysisも存在します。

”熱”があっても鼻水が出ていても，15分間マスクでセボフルレン吸入を自発呼吸を保ったまま行う麻酔によって術後に低酸素血症や肺炎を併発してしまうことがあるかどうかは誰も知らないのです。
ぼくらは別に常識に挑戦している訳ではありませんが，妙な”常識”にはとらわれない麻酔法の開発を行ってるだけなのです。

先日紹介したThe Emperor of All Maladies: A Biography of Cancerですが業を煮やしてKindle editionを買い直しました。快適です。

Yahoo知恵袋の質問を紹介しました。

「低酸素で誘導されると言われているHIF-1αが正常上皮細胞で陽性だったのですがこれはどうしてですか？」（参照）
という質問です。
”回答”が一つ掲載されていますね。これが試験だとしたら残念ながら20点くらいです。

論文は月曜日に送り返します。関連するエントリー:

• Yahoo知恵袋の質問で今までの研究成果が試される，かも。
• 今年最高と言い切ってしまいます
• 紙の本の”1Q84”
• でも重要なのは例のプロジェクトなんですよ
• 2011年のベスト〜本（ノンフィクション）〜

映画の「夏至」みたいなイメージでしょう。

Natureに
Researchers tweet technical talk

Nature 474, 431 (2011) | doi:10.1038/474431a

という記事が出てました。
科学者がtwitterに代表されるようなsocial mediaをどのように利用するようになってきているかについての簡単な記事です。
NEJMのこの有名な論文(Early Goal-Directed Therapy in the Treatment of Severe Sepsis and Septic Shock)を俎上に上げての60人規模のtwitte上の”討論会”の紹介もあります。

少し前にも
Peer review: Trial by Twitter　

Nature 469, 286-287 (2011) | doi:10.1038/469286a

こんな記事もあり，こちらはまさにtwitterを論文の査読に使うという試みについて解説しています。
少数の利害を明らかにもった査読者による査読よりも広がりと深みが大きな査読が可能になるのではという議論です。
ちょっと前話題になった”ヒ素生物”の論文にまつわる話も出ています。
こういう話題性のある論文では皆燃えまくってコメントを出すのですが，例えばPLoS Oneでコメント機能がどれだけworkしているかは疑問です。

昨日の続きです。
新しいMac OS　Lionでは”バージョン”という機能が実装されるようです。
つまり

一歩一歩をチェックできる。
書類が完成するまでには、様々な変更がつきもの。OS X Lionは、あなたが書類を開くたびに新しいバージョンを自動的に作ります。作業中は1時間ごとにバージョンを作成。いつでも好きな時に、手動で書類のスナップショットを作ることもできます。バージョンはTime Machineに似たインターフェイスで、現在の書類の隣に、以前の書類を時系列に沿って連続表示していきます。

比べる。コピーする。共有する。
過去のバージョンの中から、特定の時間の作業の状態を見たい場合は、タイムラインをクリックしましょう。全体を見たい時は、一つのバージョンをクリック。複数のバージョンの間でコピー&ペーストしたり、以前のバージョンに戻すこともできます。書類の共有は、最新のバージョンだけで行います。そこにたどり着くまでの苦労は、自分だけのものにしておきましょう。

ということですが，これだからといって日付を更新しながら作業履歴を残していくやり方を捨て去っても良いと言うことにはなりません。あくまで個人的にはこれで良いのかもしれませんが共同作業では通用しないと思います。

The Emperor of All Maladies: A Biography of Cancerを読み進めています。リアルな”本”を買ったのですがこれは失敗でした。この本重い上に使っている単語が難しいです。Kindleなら同じくらいの値段で軽く辞書内蔵の環境で読み進めることができました。今度から純粋な文字だけの本はすべてKindle版を買おうと思います。本自体はすごくexcitingです。たぶん邦訳が出ますー訳すのはぼくじゃないけどー。

Yahoo知恵袋というサービスがあります。”はてな”の人力検索の出来損ないのようなものですが今日偶然面白い質問を見つけました。

「低酸素で誘導されると言われているHIF-1αが正常上皮細胞で陽性だったのですがこれはどうしてですか？」（参照）
という質問です。

大学院生に投げていろんな”回答”をしてもらっています。質問が短すぎて十分な解答には不十分なのですが逆にいろんな可能性が列挙できます。皆さんも挑戦してはいかがでしょうか？関連するエントリー:

• 常識に挑戦している訳ではありません
• 2011年のベスト〜本（ノンフィクション）〜
• ガンとハイポキシア研究会は1/29・1/30
• 紙の本の”1Q84”
• 植物の低酸素応答の分子機構

Nature Medicine (2011) doi:10.1038/nm.2370

Ohhって時々思いもつかないようなホームランというか三塁打的な論文を出してきますよね。
これもぼくらの報告と相補なう良い論文ですね。

コンピュータを通じて共同作業を行う場合にファイルのやりとりをする場合があります。
ファイルの名前の付け方にもいろんなルールがあります。勝手に名前をつけるとトラブルの元になります。
wikiにも記載があるほどです。
Apple社も以下の様なことを推奨しています。

ファイルに名前を付けるときは、次の点に注意してください。

コンピュータによっては、ファイル名に特殊文字を使うと問題が発生する場合があります。したがって、ファイル名には、アルファベットの大文字と小文字（A〜Z、a〜z）、数字（0〜9）、およびアンダースコア（_）のみを使用します。

ピリオド（.）はファイル名と拡張子との区切り文字としてのみ使用し、それ以外の場所には使用しないでください。ファイル名の先頭にピリオド（.）を使用することはできません。

ファイル名に拡張子（たとえば「letter.doc」というファイル名の「.doc」や「picture.jpg」の「.jpg」）を付けることによって、どのアプリケーションでファイルを開くかを区別しているコンピュータもあります。この場合、ファイル名に拡張子が付いていなければ、ファイルをダウンロードした人は、どのアプリケーションでファイルを開けばよいかがわかりません。

また、短いファイル名が必要なコンピュータもあります。誰もが共有ファイルを利用できるようにするには、8文字以下（拡張子を含む場合は拡張子を入れて12文字以下）のファイル名を付けてください。

ぼくはファイル名になるべく日本語を使わないようにはしていますが，他人にファイルを送る場合など便利なことがあるので厳密に守っているわけではありません。しかしファイル名に”ブランク”をつかうことはありません。またファイル名にギリシャ文字などは使わないでください。妙な事が起こることがあります。
つまり”前田敦子.doc”はあっても”前田　敦子.doc”は無しで，この場合，”前田_敦子.doc”とします。”HIF-1α.doc”は無しで”HIF-1a.doc”です。
またこれは大学院の先生方にも口を酸っぱくして話していることなのですが，自分の作業履歴はすくなくとも一日の単位で保存してください。
つまり”小島陽菜.doc”というファイルで作業を始めて作業が終われば”小島陽菜20110621.doc”という風な名前で保存します。二日後に修正を加えれば”小島陽菜20110623.doc”と名前をつけます。投稿まですべてのファイルを保存するわけです。ぼくが作業をして結果を返すときは，”小島陽菜20110622-KH.doc”の様な名前をつけてぼく（KH)が修正を加えたことを明らかにして送り返します。
自分一人で作業をする場合はこういった工夫は必要で無い場合がほとんどですが，他人と共同作業を進める場合は何らかのルールがないと収集がつかなくなります。

Nature.comがScientific Reportsという電子ジャーナルを発行していることを恥ずかしながら今日知りました。

これってNature Communicationsとどう違うんでしょうね。
違いはともかくGuide to refreesというページに良いことが書いてありました。

To enable rapid and easy decisions we have developed a template approach. The review process will answer the following questions:

• Is the paper technically sound?
• Are the claims convincing? If not, what further evidence is needed?
• Are the claims fully supported by the experimental data?
• Are the claims appropriately discussed in the context of previous literature?
• If the manuscript is unacceptable in its present form, does the study seem sufficiently promising that the authors should be encouraged to consider a resubmission in the future?

In addition to answering the previous questions, referees can provide further information, including comments that may answer the following:

• Is the manuscript clearly written? If not, how could it be made more accessible?
• Have the authors done themselves justice without overselling their claims?
• Have they been fair in their treatment of previous literature?
• Have they provided sufficient methodological detail that the experiments could be reproduced?
• Is the statistical analysis of the data sound?
• Are there any special ethical concerns arising from the use of animals or human subjects?

他人の論文を断るときも断られるときもこうありたいものです。関連するエントリー:

• Chuvash polycythemia再び
• Chuvash祭り
• Mendeleyのめざすもの
• ミネルバの梟は黄昏に飛ぶのか-医療行為のリスク
• ”Scientific journals cannot guarantee the truth of the reports they publish”だってさ

不死細胞ヒーラ　　ヘンリエッタ・ラックスの永遠なる人生

生物学の研究において独創性とはどのように定義されるかというのはすごく昔から議論されてきた問題です。
生命科学まで間口を拡げればiPS cellの研究などは発明だし，創薬などについては独創という概念は比較的に適応しやすいと思いますが基礎的な生物学は生物が生物たる構造や機能の解明が目的である以上，また生物はそこにあり生きている以上，その仕組みを人間が”創造”するということはあり得ないとぼくは考えています。蛋白質や遺伝子のクローニングなどもその最たる例でしょう。対象となった蛋白質，遺伝子は研究者が見つける以前に存在しています。研究者はそれを「発見」しただけです。
発見法に新奇性はあったとしても蛋白質，遺伝子自体を「創造」したわけではありません。
そういう状況の中でまったくのconventionalな手法である性質を持つ蛋白質を同定して解析するという手法は健在です。
MCM Proteins Are Negative Regulators of Hypoxia-Inducible Factor 1

Molecular Cell, Volume 42, Issue 5, 700-712, 10 June 2011

GLS研ではこの手法で過去にいくつもの論文を報告しています。質量分析計を利用するようになりプロセスが高速化しているだけです。
そもそもHIF-1自体も考えられるもっとも正攻法を用いて単離された転写因子です。彼の方法論の根底にこれらを可能にする何かあるのだと思います。二年半彼といてかなり解ったと思ったのですがまだまだです。
同じ号のMolecular Cellに
A HIF-1 Target, ATIA, Protects Cells from Apoptosis by Modulating the Mitochondrial Thioredoxin, TRX2

Molecular Cell, Volume 42, Issue 5, 597-609, 10 June 2011

も掲載されていました。これはなかり興味深い論文です。
TRXとHIFっていろんな経路で深いつながりを持っています。その一端ですですね。
そうそう「細胞を創る」というような研究も最近あります。

平野啓一郎さんの小説「決壊」が文庫本になったようです。
以前に紹介したことがあります（参照）。

決壊〈上〉 (新潮文庫)

決壊〈下〉 (新潮文庫)

上・下合わせて1360円。タダみたいな値段ですね。

月曜日に投稿していた院生のKさんの論文の審査結果が帰ってきました。
初回は6人のreviewerにいろんな事を言われたのですが今回は3人まで減ってコメントもほとんど些末な事項になっていました。でも，一つだけ言っていることがよく理解できないコメントがありここ二日づっと悩んでいました。共著者のH田さんにアドバイスを求めたところナイスな指摘をしていただき疑問氷解です。よく考えたら初めの時のコメントもこのことを主に問題にしていたんですよ，reviewer1は。
というわけで追加実験無しでrevisionを終える決心がつきましたしこれで落とされることもないと確信しました。
久々ですねこんなにスカッーとしたのは。

ホントこうなると他人の論文を暢気に査読している場合ではありません。とっと問題点を挙げて残り一つをかたづけてしまおう。査読は一種の義務とはいえいくらやっても誰もほめてくれませんしね。自分たちの論文にはいろんな意味で人生がかかっているんだよ。

村上春樹の”What I Talk About When I Talk About Running”から

Pain is inevitable. Suffering is optional. Say you’re running and you start to think, Man this hurts, I can’t take it anymore. The hurt part is an unavoidable reality, but whether or not you can stand any more is up to the runner himself. This pretty much sums up the most important aspect of marathon running.

ほんと良いこと言いますよね。文学者の責任とかいって妙な政治的な発言などしなくて良いのに。
ぼく，中学生の時は陸上部でタダひたすら走らされていました。しんどいときに唱える言葉というか歌というか思い出すある情景がありました。研究でも臨床でも”しんどい”時に唱える「マントラ」って誰にでもあるのです。

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紫式部の欲望を読みました。
集英社のweb magazineでの連載を元に単行本としたもののようです。
章立てなどはwebで見ることができます。
酒井順子さんは前回の金閣寺の燃やし方がバカに面白かったので今回も1300円もする単行本を買ってしまいました。
「源氏物語」って「女の作った物語の中に閉じ込められた男と、男の作った時代の中に閉じ込められた女」という構図が話を面白くしている基礎にあると思います。つまり紫式部に視点を置くことによって物語を解題できることが十分可能でありまたそれは正統なのです。

紫式部の源氏物語の「雲隠」の帖は題だけで本文は伝存しないのですが橋本治氏の窯変 源氏物語の「雲隠」の章は紫式部の独白風な内容となっています。ここで語られる内容を現代的にすこし茶化せば酒井順子氏の紫式部の欲望となります。
その意味でこの「紫式部の欲望」も興味深いと思いました。
チラ見をしてこう言うだけでなく読んでみたら味わい深いと思いますよ。
そのときには是非「窯変源氏」の「雲隠」もご一緒にどうぞ。

研究室の大条先生の論文が通りました。
どう考えてもHIFの素人としか思えないreviewerの素朴な問いについて答えるために結構苦労しました。素人を説得するのは疲れますよね。
これで来春の”卒業”は保証されたのですが本命の論文はこれからが佳境ですよ。
論文のタイトルは
Fentanyl activates hypoxia-inducible factor 1 in neuronal SH-SY5Y cells and mice under non-hypoxic conditions in a µ-opioid receptor-dependent manner
雑誌はEuropean Journal of Pharmacologyです。
これでぼくにとっても脱出の前提条件の一つがクリアです。

今日のtweetです。
査読の無い日本語の総説でうそかホントか解らん自説を語っても何の意味もないぜ。
”自分がやったことを吹聴することはできても”も他人からの批判に耐え得ない。さらにそれが自分のデータに基づく吹聴でなくタダ他人のやった事を適当にまとめただけとはこれを何と云うのかな。

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Cellからです。
Pyruvate Kinase M2 Is a PHD3-Stimulated Coactivator for Hypoxia-Inducible Factor 1

Cell, Volume 145, Issue 5, 732-744

GLS研からの報告です。
pull-down screeningからここまで引っ張っていくなんて相変わらずすごいですね。脱帽です。
読むといくつかのポイントがあって興味の持ちようで多様的に示唆を与えてくれるよい論文だと思います。
最近のHIF関連の論文の中では出色だと思います。
KO miceを使った論文は余り好きではありません。自分が追試できないから。

今日のtweetです。
こういうことは瀬藤先生がいうのでリアルなんでしょうね。
ぼくは”上がりのポスト”にいるわけでなくこれから落ちていくだけの研究者なのですが，しかし言わんとされていることは自分なりに理解できます。
研究なんて自分の眼で見たとしても他人も同じ現象を観察できるとは限らない。研究費を取ってきたって自分の給料が増えるわけでないしかえって雑用が級数的にに増えていくだけとも言えます。時々事務の人何人かに根掘り葉掘り調べられたりしてホント割に合わないわけです。論文などいくら書いてもリアルライフでは何の御利益もないのになんで続けているのかについては自分でも”合理的”な答えはありません。家内などそれを批判して”ノーベル賞とれないのならさっさと研究止めてほしい”などと言うわけです。これはこれで正しい反応だなとよく思います。ぼくはぼくで研究に充てている時間を麻酔に振り替えたらすごく儲かるのではないかと常に思っています。

社会は絶えず夢を見ている途中まで読みました。いつもながら短剣を突きつけられるような考察だらけですね。サンデル本を読む時間があるのなら大澤本を読んだ方が良いと思います。関連するエントリー:

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一昨日「医療者のための伝わるプレゼンテーション」に眼を通しました。研究留学ネットで推薦されていたのですが未読になっていたのを読もうと思い立ち5/3に注文したら5/4に届いてしまいましたーamazon万歳ー。

これは明確に看護師さんをprimaryな読者として想定して書かれた本です。それ故記述は，懇切丁寧というより丁寧すぎるほどです。内容に影響はないのですが，この種の書き方に慣れない人には少し冗長と受け取られるかもしれません。
パワーポイントのfileやポスターの作り方では徳に得ることはありませんでした。
しかし前半部分である

STEP 1　Pre-Design
プレゼンテーションの目的を明確にする
　“どのような”目的を設定するか

STEP 2　Design
プレゼンテーションの設計図を描く
　プレゼンテーションの3部構成
　目次（小目標）を立てる

の項目は参考になりました。
臨床のsettingで行うプレゼンテーションでは”目的の設定”と言うことをもっと意識した方が良いなと反省しました。
プレゼンテーションでは”聴衆”を意識することは重要な事だと思います。

例えば，低酸素の専門集会での大御所のトークを聞いているとプレゼンテーションのお手本から遠いものばかりですよね。
適当な前振りからほとんど脈絡の無いトピックスがぽんぽん出てきてお終いという場合もあります。figureなどわざとちょっとしか見せないぞというように提示されたりしますがその一枚ですべてか語られるというような事は実際にあります。
却って懇切丁寧に話される方が迷惑だと言うこともあります。一見プレゼンテーションのお手本からはほど遠いのですが，しかし，実はこれも聴衆が誰か，何を求めてその場に集まっているかを見極めた結果なのだと言うこともできます。
つまり大御所にとっては，皆に元気な顔を見せて，その分野の研究の方向性を示すようなトークを行うという事が目的であり，参加者もその”ご託宣”をもらい，そのついでに旧交を温め，職を探したりまたポスドクを発掘するために集まっている。
そのような環境下ではあの様なプレゼンテーションが有効というよりベストなのでしょう。

結局プレゼンテーションは，”誰に”と言うことを念頭に置いて，”何を伝えるか伝えないかを決める”ということに尽きるのだと思います。

そうはいっても論文抄読会や症例報告ではプレゼンテーションの技術は要求されます。
決められた時間で論文や症例を要約して論点をハッキリさせて議論を促すという作業は誰でも学べば身につく一種の技術です。このようなプレゼンテーションでは「医療者のための伝わるプレゼンテーション」は非常に有効なものとなると思います。

今度の某学会では，プレゼンテーションする機会が3回あります。
全部別々の文脈ですので三者三様です。内容はもう決めました。今回は形式を意識してプレゼンテーションを組み立ててみようと思います。
一つには「高橋メソッド」をまるまる使ってみようと思っています。

昨日，電車に乗るために大阪駅に出ました。途中まで家内と一緒に駅周辺をうろうろしていたのですがすごい人出でした。

逆に西梅田の方など平日より人がまばらな印象でした。

RTEF-1, an upstream gene of HIF-1{alpha}, accelerates recovery from Ischemia.

J Biol Chem. 2011 May 2. [Epub ahead of print]

これは要検討ですね。
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カズオ・イシグロは日本語を話すと思っていたのですが公式な場では英語を話すのですね。

総じて，NHKのディレクターの意図が強く感じられた番組でした。
映画「わたしを離さないで」のプロモーション番組とも言えるかもしれませんし，彼の作品を二人の女優が朗読するのを聴けば本を読んでみよう，映画を観てみようという気にはなると思います。あのような熱心な読者を数多く獲得してるのも”大作家”の条件なのでしょうね。マキューアンとイシグロの小説が並んで移っていたシーンがありました。現代イギリスを代表する何人かの作家の一人であると云うことには間違いはないのだと思います。

父親から受けた影響，科学と文学などの様々なセンシティブな問題についてかなり率直に話していたのと思います。
個人的にも，すこし考えて見たいなと思ったissueにも何点か気づきました。

例えば村上春樹がテレビであのように率直に話すことは絶対にないだろうし，彼はエッセイでもあのような話題について感情まで吐露すると云うことはなかっし，またこれからも無いと思います。

その意味ではカズオ・イシグロ氏大サービスではないでしょうか。

その意味ではよい番組で，希有とも云えると思います。
福岡先生の英語はそううまくないことも解りました。
「すばらしい人間部品産業」ってこの番組と何かしらの関係はあると思います。

Cancer Reseachに Powis氏のラボからの論文が出てました。
The hypoxia associated factor (HAF) switches cells from HIF-1α to HIF-2α dependent signaling promoting stem cell characteristics, aggressive tumor growth and invasion

Cancer Res; Published OnlineFirst April 21, 2011; doi:10.1158/0008-5472.CAN-10-4142

このような分子を想定すればHIF-1,HIF-2の制御について理解がしやすいと思っていました。検証は必要だと思いますがすばらしい成果だと思います。

Effect of Pneumoperitoneum on Renal Tissue Oxygenation and Blood Flow in a Rat Model.

Urology. 2011 Apr 18. [Epub ahead of print]

こういうモデルが自由に作れるといろんな事ができるのでしょうね。できることとできないことがあるので仕方ありません。

ここ二週間くらい嫌になるほど麻酔をしました。あれくらい働くと脳内でいろんなトランスミッターが放出されて普通の感じでなくなりますね。
明日も当直なのですがどうなるか不安です。関連するエントリー:

• 「がんばれよ。」ー「よし来た。」
• “人間は死ぬまで生きられる”
• breaking news !! in hypoxia research
• Keystone Day 3
• MASAMIとASAMI

J Biol Chem. 2011 Apr 15. 15, 2011, doi: 10.1074/jbc.M111.238667

これはおもしろい。要検証。

Tetramethylpyrazine Inhibits Hypoxia-Induced Pulmonary Vascular Leakage in Rats via the ROS-HIF-VEGF Pathway.

Pharmacology. 2011 Apr 15;87(5-6):265-273.

これも要検証ですね。

What is hypoxia-inducible factor-1 doing in the allergic lung?

Allergy. 2011 Apr 11. doi: 10.1111/j.1398-9995.2011.02593.x.

短いパースペクティブ。

Reactive oxygen species production by forward and reverse electron fluxes in the mitochondrial respiratory chain.

PLoS Comput Biol. 2011 Mar;7(3):e1001115

Prevention of apoptosis by the interaction between FIH1 and Bax.

Mol Cell Biochem. 2011 Feb;348(1-2):1-9

これってphysiologicalまたはpathophysiolocalな意味合いが不明ですね。特に酸素分圧との関連で。

しかし，びっくりします。職場の大学病院でもまだ前近代的なパワハラもどきをする人がいるんですよ。困ったものですね。
病院の正式な会議の席上診療科を代表している人に向かって「ぐちゃぐちゃいうな」とかどういう神経しているんでしょうか。
これは一種の宣戦布告なんだと言うことでこちらも体制を整えますよ。

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「かえるくん，東京を救う」という作品がありこれは笑える作品なのだが不思議と心に残る。
”Super-frog”が現れて何とかしてほしいですこの現実を。

このSuper-frog saves TokyoをHaruki Murakamiが地震で自身で朗読しているのを聞くことが出来ます。
これはよいよ。一回どうぞ。
ここからです。

でもぼくが一番好きなのは「タイランド」です。村上氏の短編の中でも一番といっても良いかもしれません。
今回の地震津波でこの短編集があまり取り上げられないが不思議です。

テレビで枝野だの管だのの話を聞く時間があるのなら読んでみたどうでしょうか。
たったの460円だよ，一種の奇跡ですね。
ホント早く辞めた方が良いですよあの人達。でもそうはいかないでしょうけど。

【追記】
本の扉にゴダールの「気狂いピエロ」の台詞が掲げられています。

＜ラジオのニュース＞米軍も多数の戦死者を出しましたが，ヴェトコン側も115人戦死しました。
女　「無名って恐ろしいわね」
男　「なんだって？」
女　「ゲリラが115人戦死というだけでは何もわからないままだわ。一人ひとりのことは何もわからないままよ。妻や子供がいたのか？芝居より映画の方が好きだったのか？　まるでわからない。ただ115人戦死というだけ」

災害が怖いのはこういった死を遂げざるを得ない人を大量に作るからだと思っています。

Cardiopulmonary function in two human disorders of the hypoxia-inducible factor (HIF) pathway: von Hippel-Lindau disease and HIF-2α gain-of-function mutation

FASEB J. doi:10.1096/fj.10-177378fj.10-177378

Quake hits Japanese universities – March 15, 2011
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• 探せば見つかる
• 「牡蠣フライ理論」または「自分探し」
• ハイポキシア生物学の2011年を振り返って
• Chuvash祭り

は米国National Institutes of Healthの director である Fransis S .Collins氏の”The Lanaguage of Life- DNA and the Revolution in Personalized Medicien”の邦訳である。日本語訳がすばらしいということを指摘しておきます。

目次は以下の通りです。

• 序章　もう、知らないではすまされない
• 1章　未来はとっくにはじまっている
• 2章　遺伝子のエラーがあなたに出るとき
• 3章　あなたの秘密を知るときがきた？
• 4章　癌はパーソナルな病気である
• 5章　人種と遺伝子
• 6章　感染症と遺伝子
• 7章　脳と遺伝子
• 8章　老化と遺伝子
• 9章　あなたの遺伝子にふさわしい薬をふさわしい量で
• 10章　一人ひとりが主役の未来へ

邦題よりオリジナルなタイトルの方が本書の特徴をよくあらわしています。
コリンズ氏は確かに本書でDNA and the Revolution in Personalized Medicienということを強調しています。
これは明らかに一般市民を対象にした本です。ゲノム研究の成果の解説というよりそれによりどう医療が変わってきたのか，また変わるべきなのか，について書かれています。各症の最期に簡単なまとめがついていて便利です。特に重要なサイトの htmlもついているので突っ込んで勉強したい一般人にはありがたいと思いますがもちろん英語のページに飛んでいきます。

遺伝子研究の成果から医学のあり方を説いていく形式で進んでいきますが，ぼくが驚き強調したいことはそのことではありません。
63ページに嚢胞性線維症の患者さんの生存期間の中央値のグラフが出ています。
1950年代には1年くらいだった生存期間が，1980年代には18年，そして2007年には37.4年まで延長しています。そしてコリンズ氏らが Science誌にCFTRの遺伝子変異を報告したのは1989年なのです。つまりどのような遺伝子変異であるかが明らかに遙か前から患者の診療・治療に関わる人たちの不断の努力で嚢胞性線維症の患者さんの生存期間は増加し続けていたのです。
これはいくら強調してもしすぎでないことだと思います。

この本の最期に私たちが取るべき行動がまとめられています

1. 研究

米国でさえ医療費の5％程度しか医学研究費に使われていないし，NIHのグラントの採択率は20％以下だということだ。もっと増やせとNIHの長官として全く正当な主張です。

2. 電子カルテ

プライバシーだの何だといわず患者の情報をまとめる「電子カルテ」を整備しろ。これはぼくは賛成です。

3. 政策決定

日本で一番遅れている分野。

4. 教育

患者教育だけでなく医療関係者の教育も必要。医者であるあなたがこの本を読まなければいけない理由です。

5. 倫理問題の解決

いわずもがな。ちなみにコリンズ氏はガチのキリスト教徒です。（参照）

ちなみに遺伝性の多血症(polycythemia)は大きく分けると4タイプ存在します。

1. erythropoietin受容体遺伝子(EPOR)の異常 (OMIM 133100)

何種類かの変異が知られていて truncated formで持続活性化型変異も知られています。

2. von Hippel Lindau遺伝子(VHL)の異常 (OMIM 263400)

Chuvash polycythemiaですね。
一種類の変異が知られています。

3. prolyl hydroxylase, PHD2 (EGLN1)の異常 (OMIM 609820)

三カ所の変異が知られています。

4. hypoxia-inducible factor 2a (EPAS1)の異常(OMIM 611783)

これは四ヶ所の変異が知られています。肺高血圧症をともなうこともあります。

の4タイプです。
このうちChuvash polycythemiaは常染色体劣性遺伝の形式ですが他の三つは常染色体優性遺伝の形式を取ります。
ちなみにOMIMはOnline Mendelian Inheritance in Manのことです。データベースになっています。（参照）

ところでこれってすごいです。

Materials for multifunctional balloon catheters with capabilities in cardiac electrophysiological mapping and ablation therapy

Nature Materials (2011) doi:10.1038/nmat2971

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今日の午後普段のjournal clubの代わりに東大の三村維真理先生のセミナーに参加しました。
セミナーの内容に元々興味を持ってたこともあり大変よいセミナーだったと思います。
ぼくと1.5廻りはお若いはずです。これからどんどん良いデータ出していってください。

JBCから
Differential sensitivity of HIF hydroxylation sites to hypoxia and hydroxylase inhibitors

JBC doi: 10.1074/jbc.M110.211110 jbc.M110.211110.

書いてある通りなのでしょうね。

Nuclear Localization of Factor Inhibitor Hypoxia-Inducible Factor in Prostate Cancer Is Associated With Poor Prognosis

J Urol

ホントかな？　泌尿器科の先生に頼んで全部読んでから判断しよう。

【追記：業務連絡】例の論文今日の午前に最後のポチしました。
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麻酔科管理の12件を含む30件の手術がぼくらのデイサージャリー診療部でありました。
ここまで詰め込むと予定表に余白が全くありません。

同僚のU田先生が今日で産休に入られます。予定日の4/8はお釈迦様の誕生日です。元気な赤ちゃん産んでください。

しかし花祭りは重要ですよクリスマスより。

NEJMに

NFKBIA Deletion in Glioblastomas

N Engl J Med 2011; 364:627-637

という論文がありました。

これは執念ですね。ビックリしました。
もう一つは
Hypoxia and Inflammation

N Engl J Med 2011; 364:656-665

Eltzschig氏とCarmeliet氏の共著です。

残念なことに新しい視点は一切ありません。

でもよくまとまっています，当然的に。

Scienceで「Dealing with Data」という特集が掲載されていました。
その中で
Metaknowledge

Science 11 February 2011: 721-725.

に妙に感心しました。

これは良い論説ですね。

今日，D条先生が出してくれたデータで論文のrevisionお終いとします。週末の間置いておいて月曜日にポチッとします。

これは受け入れられると思っています。

ご苦労様でした。でも重要なのは例のプロジェクトなんですよ。

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Cardiac response to hypobaric hypoxia: persistent changes in cardiac mass, function, and energy metabolism after a trek to Mt. Everest Base Camp

The FASEB Journal vol. 25 no. 2 792-796

Caudwell Xtreme Everest Research Groupの研究成果です。

高地ではPCr/ ATPが低下するような心筋の代謝変化が起こるというレポート。

心不全患者では脱共役蛋白質（UCP)のレベルが上昇し，グルコース・トランスポーター（GLUT4）の発現が低下するという結構有名な研究があります。

高地ではこれと似た変化が起こるようです。
Uncoupling proteins in human heart.

Lancet. 2004 Nov 13-19;364(9447):1786-8.

以前にも紹介したことがありますが，Arterial Blood Gases and Oxygen Content in Climbers on Mount EverestもCaudwell Xtreme Everest Research Groupの研究成果です。

結局雪は解けました

The Hot Spotters

Can we lower medical costs by giving the neediest patients better care?
がNew Yorkerで出てました。

Hot Spottersというのは，経済的なものを含む様々な理由で社会的な弱者となっている人が同時に医療費を集中的に消費するhot spottersとなっていて,そのhot spottersへの選択的，集中的な主に社会的な介入によってcommunityや保険グループの保健費用を減らすことができたという米国でのいくつかの試みを紹介したものです。

こういうhot spottersは病院単位でも存在するようです。hot spotterは救急外来の受診などの頻度も高くそれらへの対応なども含め病院に負担を強いる hot spotterへのサポートにより結果として病院の負担の軽減を図り病院の収支を改善できる可能性があるようです。

インシデントレポートの解析によれば特定の何人かの医療従事者に関するインシデントが病院全体のインシデントで高い比率を占めています-ソースは明かせません-。

合併症を作る頻度の高い外科医とか麻酔科医とかが実際に存在します。つまり hot spottersは患者だけでなく医療従事者の中にも存在するわけです。

ぼくのようなしがないバカで無能な大学病院の教員にはどうすることもできませんけどね。

ところで，バカだといわれるとほんとやる気を失いますね。所属大学だけで８人の学生の学位の指導をしてきたのですが。ほんとバカで済みませんでした。
でもこれぼくのせいではありませんから，生まれつきなんです。ほんと身の振り方を考える時期ですね。

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PLoS Genet. 2011 Jan 27;7(1):e1001285.

これは面白いのだが 293細胞やHeLa細胞でこれほどの誘導を観察したことはないな。その眼でもう一回見てみようかな。

Aberrant Promoter CpG Methylation Is a Mechanism for Impaired PHD3 Expression in a Diverse Set of Malignant Cells.

PLoS One. 2011 Jan 28;6(1):e14617.

やっとでました。
Cellular hypoxia of pancreatic {beta}-cells due to high levels of oxygen consumption for insulin secretion in vitro.

J Biol Chem. 2011 Feb 4. [Epub ahead of print]

いつもお世話になっています。熊本に行かれる前に京都で一献差し上げます。

今日から新しい論文への取り組みはじめました。

今月中に draft完成させたいけどぼくは遅筆だかからな〜

タスマニアデビルはネコ科の肉食有袋類です。
月曜日の朝5時のNHKのニュース報道を見て初めて知りました。

いわゆる絶滅危惧種です。

このタスマニアンデビルには，デビル顔面腫瘍性疾患（英：Devil Facial Tumour Disease, DFTD）というタスマニアデビルの顔面や頚部に発生する致死性の悪性腫瘍（癌）があるのだそうです。

お互いに噛み合っているうちに伝染するのだそうですが未だ実体は不明なのだそうです。

肉食なのですがなかなか愛嬌のある動物です。

「箱舟」プロジェクト(Devil Ark)というプロジェクトとう運動があります。

タスマニアデビルをオーストラリア本土の4つの自然動物公園へ送り込んでDFTD freeな環境での繁殖を図る試みです。

とりあえず寄付しました。

Kazuo Ishiguroの小説わたしを離さないでが映画になるようです。
これは観ようと思います。

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