空は真っ青なのに吹雪いているというような不思議な天気でした。
手術室の廊下からよく見えるのです。
夕ご飯に外出したとききれいな満月が東山から昇ってきたところを見ました。空は澄み渡っていて本当にくっきりすっきりの月でした。
昨日と今日の御大のブログエントリーがネットで話題になっています。
昨日のエントリーは「科学技術政策の底で：貯蓄型から宝くじ志向生活へ」です。
有名ジャーナルにでると、研究費がもらえる、ありきたりジャーナルにいくらだしても研究費はもらえない。これが真実かどうかではなく、そういうふうに日本の研究者の多くは考えているのです。
ぼく自身はこう考えた時期もありましたが某研究所を辞めるときにそういった考えとはきっぱりと縁を切りました。基本的には自分の興味のある事をできる範囲でするというスタンスです。今後はわかりませんが幸い今まで何とか研究を継続してくることができました。
重点領域、重点研究、などといっているうちに、国立大学の研究室ではほんらいあるべき研究が歯がぬけるように減っているのではないでしょうか。
これはそうかもしれません。特に臨床講座では格差が激しくなっていると思います。麻酔科学教室が手がけるのは生理学または薬理学の延長上にある研究テーマであり余りお金になりません。学内でも全然お金とポストが廻ってきません。
根本的には普通の研究をしてつましくても長期の研究をしたいと願う若者がどんどん減っているのです。なぜなら、そういう若者の存在をまったく日本は奨励しなくなったからです。
研究が射倖性の高い職業になってしまったのです。
くじに当たるはずれるといような次元で研究とつきあっていると「脳」を病んでしまいます。一方，医者は自分の行為が絶対的に他人の為になっているのだと確信でききる局面に遭遇できます。精神衛生上とてもよろしい。
ぼくは，臨床の片手間に研究をしているわけでもないし，研究の慰みに臨床をしているわけでもありません。ぼくにとっては両方必要なのです。
高村光太郎に「自分と詩との関係」という一文があります。こんな心境なのです。
どちらかを捨てろと言われたらそれは断然，研究を捨てますけど。
今日のエントリーは「国はうすくひろく、民間がとくべつなものを支える」です。
そして研究成果はその内容を発表内容、つまり論文で評価してほしい。どこのジャーナルに出版したかではなく、研究内容で評価してほしい。
成果を生みだす研究者と成果を評価する目利き、の両方が平等な立場で研究継続の可否を審査して欲しい。こうしてもたぶんみなが研究費を得られるわけではない。でも日本の科学技術の世界が一変するでしょう。いまのようなばくち的な雰囲気が一変するでしょう。まさに持続可能な研究世界がうまれてくるとおもいたいのです。
これは難しいですよね。国が配る研究費の審査でも公平とはほど遠い状況だと思います。「目利き」が例えば麻酔科学の分野でどれくらいいるのでしょうか。
少なくとも「どこのジャーナル」に掲載されたかではなく何回引用されたとかそのような基準を導入して審査に客観性を持たせてもらいたいと思います。そのためには5年とか10年くらいの長さが必要な場合もあると思います。例えば5年で20回引用されない論文は産業廃棄物ですし，個人的には100回の引用を目処に考えています。100回以上引用された論文は自分の中でもよい論文だと考えています。他の研究者の評価もこういったことを基準に考えています。
これすごく面白いと思います。ぼくも似たようなことを考えていました。
J Biol Chem. 2012 Feb 3.
そうそう「魚は痛みを感じるか？」は面白いですよ。変な麻酔関連の雑誌に出いてる総説を読むよりよほど日常の臨床にとっての示唆を多く得ることができると思います。
昨日の当直は辛うじて昨日のうちに終わり寝たはずなのですが，夜中にPHSが鳴った様な気がして起きてしまいそれ以後眠れなくなってしまいました。一回起きてしまうとやはり当直室は寒く感じられこれでいかんと思い早々に研究室に移動してエアコンのスイッチを入れてオイルヒーターで暖をとっていました。困ったものです。
New York Timesを読んでいたら面白い記事というかエッセイを見つけました。
アメリカの元財務長官でハーバード大学の学長もしたサマーズ氏の”What You (Really) Need to Know“というタイトルです。
時代が変わっているのだから教育システムも変わる必要があるということを主張した文章です。
このエッセーを巡って紙上debate(“English Is Global, So Why Learn Arabic?“)も開催されています。
主張が箇条書きにされているのですが少し引用してみます。(ぼくが一部を太字にしました）
- Education will be more about how to process and use information and less about imparting it. This is a consequence of both the proliferation of knowledge — and how much of it any student can truly absorb — and changes in technology.
- An inevitable consequence of the knowledge explosion is that tasks will be carried out with far more collaboration. As just one example, the fraction of economics papers that are co-authored has more than doubled in the 30 years that I have been an economist.
- New technologies will profoundly alter the way knowledge is conveyed. Electronic readers allow textbooks to be constantly revised, and to incorporate audio and visual effects.
- As articulated by the Nobel Prize-winner Daniel Kahneman in “Thinking, Fast and Slow,” we understand the processes of human thought much better than we once did. We are not rational calculating machines but collections of modules, each programmed to be adroit at a particular set of tasks.
- The world is much more open, and events abroad affect the lives of Americans more than ever before. This makes it essential that the educational experience breed cosmopolitanism — that students have international experiences, and classes in the social sciences draw on examples from around the world.
- Courses of study will place much more emphasis on the analysis of data. Gen. George Marshall famously told a Princeton commencement audience that it was impossible to think seriously about the future of postwar Europe without giving close attention to Thucydides on the Peloponnesian War.
まあこれってよく言われることですよね。ちきりん氏の「自分のアタマで考えよう
」でも同じような主張はされています。でもサマーズ氏がこのようにまとめると権威あります。
このエッセーでサマーズ氏は
English’s emergence as the global language, along with the rapid progress in machine translation and the fragmentation of languages spoken around the world, make it less clear that the substantial investment necessary to speak a foreign tongue is universally worthwhile. While there is no gainsaying the insights that come from mastering a language, it will over time become less essential in doing business in Asia, treating patients in Africa or helping resolve conflicts in the Middle East.
と述べているのですがこの部分について紙上debateが行われています。
たぶん近い将来にに日本語をしゃべったり書いたりするそばから英語やフランス語に翻訳されていくシステムができると思います。
留学をしない，しなくてもよい理由をいくら並べてみても栓がありません。当たり前ですが英会話がうまくなるために留学するわけではありません。より広い視野を獲得するために留学するのですから。
Nature Cell Biologyに
The LIMD1 protein bridges an association between the prolyl hydroxylases and VHL to repress HIF-1 activity
Nature Cell Biology (2012) doi:10.1038/ncb2424
という論文が出ていました。これは面白いです。しかしこの論文はぼくらの2001年の論文の解析の途中でもある程度予想されていたような事象だと思います(参照-Web of Scienceの統計では507回引用されたようです。）。
今年も「キアドラ」が届きました。
医学界新聞を読んでいたら”Experimental Design for Biologists“の邦訳「バイオ研究のための実験デザイン -あなたの実験を成功に導くために」が出ているのを知りました。日本語は読んでいませんがよい本だと思います。
ハイポキシア生物学の2011年を振りかえって今年のブログ納めにしようと思います。
昨年同様まず統計から。
pubmedを（HIF[TIAB] and 2011[DP]）で検索すると1291件と出ました。昨年が1136件でしたのでほぼ同じ勢いです。毎日3つ以上HIF関連の論文が出版されているのです。
また(hypoxia[TIAB] and 2011[DP])だと4652件。昨年が4167件でしたのでこちらはたぶん有意に増加ですね。
ちなみに(iPS[TIAB] and 2011[DP])は 598件ですし，(anesthesia[TIAB] or anesthesiology [TIAB]) and 2011[DP] は4679件です。
酸素がさまざまな生命現象に関わっているということがあるので酸素分圧感知機構-HIFの経路も様々な生命現象に関わっています。すでに2000年にはGLSによるこんな総説が出ているほどです。
そして今年はとうとうNEJMに
Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease
N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.
が掲載されました。快挙ですね。
昨年
来年はHIFの活性化機構を原理として利用する方法でない細胞内酸素分圧のimagingが可能になってくると思います。今年発表されたいくつかのprobeを使ったよい研究が出て来るのが楽しみです。
と書きました。
理想のプローブは今年も現れませんでしたが
Hypoxia-sensitive fluorescent probes for in vivo real-time fluorescence imaging of acute ischemia.
J Am Chem Soc. 2010 Nov 17;132(45):15846-8
で記述されているローブには興味を引かれました。
研究会でも直接お話しを伺うことができました。
腎臓は酸素消費量が多くHRE依存的な遺伝子発現が通常酸素分圧下で生きているマウスでも観察されます。このような領域を低酸素領域と呼ぶかどうかは別としてこの程度のHIFの活性化をある程度の線形性をもって表現できる低酸素プローブが開発されてリアルイメージングに応用できるとよいと思います。
ぼくのほしいプローブはこんなプローブです。よろしくお願いします。できたらはじめに使わせてください。
その他の低酸素プローブにはあまり興味をもてませんでした。
Natureに植物の低酸素応答に関する論文が二つback-to-backで出ていました。
Oxygen sensing in plants is mediated by an N-end rule pathway for protein destabilization
Nature. 2011 Oct 23;479(7373):419-22. doi: 10.1038/nature10536.
と
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants.
Nature. 2011 Oct 23;479(7373):415-8. doi: 10.1038/nature10534.
たぶんぼくは完全に理解はできないと思いましたがネタとしては知っておくのがよいと思ったので読んでみました。
TRPA1 underlies a sensing mechanism for O2.
Nat Chem Biol. 2011 Aug 28;7(10):701-11. doi: 10.1038/nchembio.640.
もよい論文です。TRP channelがサブタイプ特異的に環境の酸素分圧の上がり下がりをセンスしていてるということを示した論文です。この論文も著者の高橋さんにぼくらの勉強会でセミナーをしていただきいろんな話を聞けました。来年度やりたい人がいれば挑戦していただきたいとぼくは思っています。
今年も医科研の坂本先生のMint3ネタで論文が出ています。
Deletion of the Mint3/APBA3 gene in mice abrogates macrophage functions and increases resistance to lipopolysaccaride-induced septic shock.
J Biol Chem. 2011 Sep 16;286(37):32542-51.
Pyruvate kinase M2 is a PHD3-stimulated coactivator for hypoxia-inducible factor 1.
Cell. 2011 May 27;145(5):732-44.
MCM proteins are negative regulators of hypoxia-inducible factor 1.
Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):700-12.
Hypoxia. Cross talk between oxygen sensing and the cell cycle machinery.
Am J Physiol Cell Physiol. 2011 Sep;301(3):C550-2.
これらもよかったです。
GLS件はやはり一歩進んでいる感じがします。
以前といってもぼくが大学生の頃NHKのFM放送に作家の五木寛之が出演していて自分の立ち位置をトラック競技になぞらえて話していたことがあり今でも記憶に残っています。つまり自分は他のランナーの集団から少し先を走っているのであるがその少しはそのように見えるだけであって実はトラック一周先行した上での少し先なのだと。生命科学の世界でもそのような研究室ってありますよね。
そうそう
Control of T(H)17/T(reg) balance by hypoxia-inducible factor 1.
Cell. 2011 Sep 2;146(5):772-84.
これも印象的でした。先行論文があったのですがこっちはCellということで勢いの違いはあるのだと思います。
Mol Cell. 2011 Jun 10;42(5):597-609.
thioredoxin関連はいつも注目しています。
また腎臓のEPO産生細胞についての京大の柳田さん-御大ではありません。念のため。でも御大みたいなものかも-の研究室の
Dysfunction of fibroblasts of extrarenal origin underlies renal fibrosis and renal anemia in mice.
J Clin Invest. 2011 Oct 3;121(10):3981-90. doi: 10.1172/JCI57301
と
東北大学の山本先生のお部屋の鈴木さん方の
Isolation and characterization of renal erythropoietin-producing cells from genetically produced anemia mice.
PLoS One. 2011;6(10):e25839.
はすごいと思いました。
論文を読むとPapersで整理して☆をつけます。
最高が☆☆☆☆☆なわけですが，今日整理していて
Hypoxia increases transepithelial electrical conductance and reduces occludin at the plasmamembrane in alveolar epithelial cells via PKC-ζ and PP2A pathway.
Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2011 Apr;300(4):L569-78.
にも☆☆☆☆☆がつていました。
これ麻酔科医にとってはとても興味深い論文です。
低酸素関連で
Hypoxia and inflammation.
N Engl J Med. 2011 Feb 17;364(7):656-65.
Oxygen Sensing, Homeostasis, and Disease
N Engl J Med. 2011 Aug 11;365(6):537-47.
の二篇NEJMに出たのには感動しました。
この世界Nature, Cellといっても十分でなくNEJMに総説として取り上げられてやっと一人前という世界ですから。
最後にぼくの研究室の論文を紹介してお終いにしたいと思います。
Hydrogen Sulfide Inhibits Hypoxia- But Not Anoxia-Induced Hypoxia-Inducible Factor 1 Activation in a von Hippel-Lindau- and Mitochondria-Dependent Manner
Antioxid Redox Signal. 2012 Feb 1;16(3):203-16. Epub 2011 Oct 17.
院生の甲斐さんの論文です。
これは結構引用される論文になると思います。
気がついた論文を列挙してみました。
今年☆☆☆☆☆をつけた論文が20篇ほどありました。☆☆☆☆で 10篇くらいです。ですので紹介したのはほんの一部です。
というわけで今年もこのブログ愛読ありがとうございました。
今の職場を辞めるまで続けると思います。
それでは皆さんよいお年をお迎えくださいませ。
