エルデシュ数というのがあります。
wikiに依れば

エルデシュ数（エルデシュすう、Erdős number）またはエルデシュ番号とは、数学者同士、あるいはもっと広く科学者同士の、共著論文に よる結び付きにおいて、ハンガリー出身の数学者ポール・エルデシュとどれだけ近いかを表す概念である。

ある者が新たにエルデシュ数を得るためには、すでにエルデシュ数が与えられている者と共著で論文を書かなければならない。エルデシュ自身はエルデシュ数 0 を持つただひとりの人物とされ、エルデシュ数が n の者と共著で論文を書いた者にはエルデシュ数 n + 1 が与えられる。
エルデシュは83年の生涯に約1500本の数学論文を書き、その多くは共著であった。彼と直接の共著論文がある数学者は511名に及び[1]、彼らにはエルデシュ数 1 が与えられる。エルデシュ数 1 の者と共著論文があり、エルデシュとは直接の共著論文がない者にはエルデシュ数 2 が与えられる。エルデシュ数が 2 である者は、2007年2月28日の時点で8162名いる[2]。以下同様に、エルデシュ数 n の者と共著論文があり、エルデシュ数 n 未満の者とは共著論文がない者には、エルデシュ数 n + 1 が与えられる。エルデシュ数をすでに持っている者との間に共著論文がない者には、エルデシュ数が与えられない（もしくはエルデシュ数が ∞ であると定義する）。

ということになります。

当然、本庶佑数とか成宮周数とかを同様に定義することが可能です。

同じ研究領域に属していても∞ という場合もあるが、結構近いつながりである場合の方が多いです。

今回のKeystone symposiumの参加者でもぼくのSemenza数は1なのだが、Maxwell数も1だしだとすればRatcliffe数は2である。Poelinger数も2である。計算はしていないがKaerin数も5か6くらいには収まるのではないだろうか。
それがどうしたといわれると困るのだがスゴイではないか。

これをスモールワールド現象と呼ぶのだそうです。
平均6人の知り合いを介して任意の二人がつながっているのです。

ちなみにぼくの本庶佑数、成宮周数は2であるし沼正作数も2だ。関連するエントリー:

• Keystone 雑感-3
• Twitter Weekly Updates for 2010-01-24
• Keystone Day 1
• Keystone 雑感-2
• Keystone symposia, “Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways” #hypoxia

今回の meetingでほとんど取り上げられれいなかったものの一つにimagingがあります。低酸素領域のimaging, HIF活性化領域の imaging共に皆無といいって良かったと思います。また固形癌を低酸素と安易に結びつけるようあん話しもなくその意味ではバランスが良く取れていたという事になります。酸素の有る無しを純粋にimagingできる技術の開発が急務だと思います。そうでないと観察結果は曖昧な解釈にとどまることになります。

他方、様々なphysico-chemicalな刺激、環境変化が低酸素応答、HIF活性化に及ぼす影響の検討も欠落していました。これは残念です。少なくとも放射線照射後のHIFの活性変化の話しが一つでもあれば良かったとのにと思います。
これは”雑感-２”でも書いたことと関連があります。
今後もう少しバランスの良いmeetingになっていくのかあくまでもHIFを中心課題としたものにとどまるのか主催者の考え次第ですね。

トンネルの入口

今年はFIH-1に関する研究成果がどんどん出てくるでしょう。 dioxygenaseでないFIH-1も来ます、必ず。

また低酸素応答としてepigeneticsの観点からの解析が進むと思います。

各論的には stem cellと低酸素応答もしかしたら”低酸素”でなくHIFという領域もしばらくは論文が出版され続けるでしょう。
ぼく自身のトピックスは HIF-1/HIF-2問題です。いままで目を背けけ手きましたが残りの研究人生ですこし考えてみたいと強く思いました。やっぱり腎癌とマクロファージかもこれを考える土俵は。

トンネルの中

Keystone symposia次回はバンクーバーに戻って欲しいです。近いし標高低いから…

Keystone symposia, Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathwaysの個人報告を終わります。
関連するエントリー:

• Keystone symposia, “Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways” #hypoxia
• Keystone Day 3
• Keystone Day 4
• Keystone Day 5-最終日
• Keystone 雑感-2

前回のKeystone hypoxiaでも取り上げられて現在でもかなり追求されていて未解決なもののひとつにHIF-1/HIF-2問題があります。
低酸素や増殖シグナルによって惹起されるシグナルが HIF-1とHIF-2をdifferentialに制御するその分子機序やその後のイベントの細胞生物学的な意味などはまだまだ解明されたとは言えません。ましてやHIF-3の生物学は大きく遅れています。
まず細胞、組織が異なればHIF-1/HIF-2の意味が異なるだろうと考えられます。1990年代にはHIF-1aとHIF-2a(EPASという名前で呼ばれていていまでも好んでこの呼名を採用する人はいます）ではｍRNAの組織発現パターンがことなりHIF-1aは比較的にユビキタスな発現パターンに比較して、HIF-2aは血管系を中心と比較的な限定的な発現パターンを示すと報告されてきていたのですが現在ではこのような発現の差異をことさら強調することは無くなっているような気がします。
今後ここら編のbrakethroughは腎癌研究からくるのではないかと思っています。

また低酸素応答はHIFを介したモノばかりではありません。肺血管の低酸素誘導性収縮は一時的にはHIFとは無関係ですがこの現象における”酸素分圧センシング”の機序は未だに解決されたとはいえません。ここらへんは今回のmeetingでは完全にスルーでした。

”雑感”はあと一回くらいで終わり通常モードに戻ろうと思います。

今日もこれから手術室です。では。

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• Keystone 雑感-3
• Keystone Day 2
• Keystone Day 1
• Keystone symposia, “Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways” #hypoxia
• がんばれよ・よーしきた

今回の大きなポイントは

”代謝”

だったと思います。

最終日のmetabolismのセッションのTak Makのトークで代謝とガンとの接点が意識的に取り上げられましたがここに今回のsymposiumのポイントの一つがありました。

もう一つ印象深かったのは３日目午前の”Cancer”のセッション。前半に Dr.KaelinとDr.Maxwellを含めた３人が腎癌の話をしました。腎癌って他のガンと全く様相のことなる癌だったのだと初めて明確に認識しました。
その後泌尿器科医のN村さんとかなり話し込みさらに納得。ここら辺に関して理解が深まったのは今回の収穫の一つでした。

Keystoneの標高は約2800mです。吸入の酸素分圧は110-120mmHg程度だと思います。この程度に一気に駆け上ると、小走りに走るだけでかなりの息切れを自覚しました。jet lagからなかなか回復しないように感じたのはこの高さ故ではなかったかと思っています。肺胞低酸素は怖いですね。

PNASにTak Makも入ったグループからのDJ-1に関する論文が出ています

DJ-1 protects the nigrostriatal axis from the neurotoxin MPTP by modulation of the AKT pathway

PNAS published online before print January 26, 2010, doi:10.1073/pnas.0914876107

Cellには

The Histone Deacetylase Sirt6 Regulates Glucose Homeostasis via Hif1α

Cell, Volume 140, Issue 2, 280-293, 22 January 2010 

PLoS Oneには
Myc Is Required for Activation of the ATM-Dependent Checkpoints in Response to DNA Damage

PLoS ONE 5(1): e8924.(2010)

Appleのタッチパネルぼくは一日勘違いしていました。
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• がんばれよ・よーしきた
• Keystone Day 5-最終日
• Keystone 雑感-3
• Keystone symposia, “Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways” #hypoxia
• Keystone 雑感-2

完全に凍結するUS70を65mphで東に爆走する4WDの中で不安にさいなまれながらK応のT田先生としゃべり続けデンバー空港に到着。
酸素分圧が高いと言うことが高いということの幸せをかみしめながらBurger Kingで朝食を摂りました。-大好きなPanda Expressが隣にあったのですが５時では空いていませんでした-
デンバーの飛行場で同行の徳島のT田さんが、なんとスキャン箱に入れられてしまいました。隠し持っていた葛根湯の分封がきっかけともいわれていますが詳細は謎です。あのまま別室に連行されたらと思うと結構ハラハラしました。葛根湯を米国人に説明するのは至難の業です。
乗り換えのロスアンゼルスはたいしたことはなく成田行の機上の人となりました。ぼくは11時間の内の7時間は寝ていたと思います。
結局行きと帰りで見た映画は”パンドラの匣”と”クヒオ大佐”の二本でした。今回のエントリーのタイトルは”パンドラの匣”のセリフです

今日は５時に起きて自宅を出て手術室で働きました。不思議なくらいjet lagなど感じません。いつも不規則な生活なので誤差範囲ということになってしまっているのでしょうか。それはそれで困ったことです。

Structural analysis to determine the core of hypoxia response network.

PLoS One. 2010 Jan 19;5(1):e8600.

これはわかったようでわからん話ですね。ぼくにとっては。

Optimizing the Delivery of Cancer Drugs That Block Angiogenesis

Sci Transl Med 20 January 2010:
Vol. 2, Issue 15, p. 15ps3

これは最近良くある話。よくまとまっていると思います。

ホテルとカンファレンス会場を結ぶ不気味なトンネルの中の絵

寝て起きるとappleの例のタッチパネルが発表されているのでしょうか。楽しみです。

というわけで

がんばとっるか・やっとるぞ

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• タスマニアンデビル
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• Keystone 雑感-3

朝から降ったりやんだりの天気で寒かったです。

午前中は

Metabolismから

Dr. Schofield: Iron- and 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases

とてもためになる話しでした

Dr. Mak: Fatty Acid Oxidation and Survival of Cancer Cells

内容がどんどん飛んで行くのですが最後は妙に納得

Dr. Chandel: Mitochondrial Complex III Regulates Signaling

パス

Dr. Hekimi: Mitochondrial ROS Increases HIF-1alpha Expression and Enhance the Immune Response in Long-Lived Mclk1+/- Mutant Mice

そうなのかな

Dr. Cantley: Control of Glycolysis in Cancer Cells

総説的な話し

Dr. del Peso: Hypoxia Promotes Glycogen Accumulation through Hypoxia Inducible Factor (HIF)-Mediated Induction of Glycogen Synthase 1

細胞の話しとしてはわかるが、あそこまで言われるとな〜

夕方からは
Stress Responses to Hypoxia

Dr. Keitzmann: Signalling Cross-Talk between Hypoxia and Insulin

かなりいい話　検証してみます

Dr. Huang: HIF-1alpha, Genetic Alteration, and Tumor Progression

データがクリア過ぎるほどクリア　ホントならすごすぎる話しでは

Dr. Giaccia: Stress Responses Induced by Hypoxia that Modulate Tumor Progression

Dr. Eckle: Adenosine-Dependant Stabilization of Period 2 Promotes Metabolic Adaptation of the Myocardium to Limited Oxygen Availability

麻酔科の人ですよコロラドの　驚くと言えば驚くような話しです

Dr. Heiserich: PHD3 Activity Regulates Hypoxia-Induced Actin Cytoskeleton Rearrangement and Cell Migration

これもタイトル通りならすごい

最後はダンスパーティーでお開き

帰国したら色々書いてみます　　発表の要約は詳しすぎると会の principleに反することになるのであんなもので終わってしまいました

あと３時間半でkeystoneを出ます
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• がんばれよ・よーしきた

ぼくはiPhoneとMacbook Airを持って出発しました。

まずMacbook

伊丹空港、成田空港ではe-mobileの pocket wi-fiで問題なし。
サンフランシスコ空港ではfreeのポイントを見つけることが出来ませんでした。 T-mobileの提供するポイントに一日$7.99ドルでDaypassをクレジットカードで購入しました。まる24時間接続できます。

デンバーでも freeのポイントを見つけることが出来ませんでしたし T-mobileの電波もなく接続はしませんでしたが、デンバーではしかし探せば見つかったようです。

Keystoneのホテルではホテルが提供するwi-fiのアクセス・ポイントがあり無料で接続出来ています。

近くの店でもやはり別のアクセス・ポイントが見つかり無料で接続できました。

学会の会場は立派なカンファレンスセンターなのですが無線のアクセス・ポイントはなく有料で接続する必要がありましたので接続せずでした。

次にiPhone

伊丹空港でも、成田空港でも3Gで接続して当たり前ですが問題なし。飛行機に載っている間は機内モードにして滞米中はずっと機内モード。

サンフランシスコ空港、デンバー空港、ホテル、カンファレンスセンターでもmacbookと事情は同じでした。wi-fiで接続中はskypeで日本の家族と通話できました。便利な時代になりましたね。

大都市の街中ではどうなのかは今回はわかりませんが、とにかく現在アメリカではそこら中で自由につながるという状況ではないようです。

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• Keystone 雑感-1
• がんばれよ・よーしきた
• Keystone 雑感-2
• Keystone Day 0

朝起きるとサラサラの新雪が５センチほど積もって見かけ上白銀の世界となっていました。

午前は日差しが戻りましたが午後からは曇

symposiumは午前は
Stem Cells and Hypoxia

演者でこのタイトル通りの話しを貫いたのは我らが日本代表の須田先生だけでした。

Simon氏もPoellinger氏も stem cell関係はとっとと切り上げ自分たちの世界に突入していました。

Dr.Simon: Hypoxia and Stem Cells

肺がんの未発表データがおもしろい

Dr.Suda, Hematopoietic Stem Cell in Hypoxic Niche
セッションのテーマのど真ん中の話し
Dr.Poellinger: Hypoxia Signaling of Notch

これも未発表データがちょっと興味を引きました　よく考えると意味が今ひとつ不明ですが

Dr.Maltepe : Mitochondria and Stem Cell Fate in the Placenta

Dr.Acker: A Hypoxic Niche Regulates Glioma Stem Cells

Dr.Schipani; Dual Action of Von Hippel Lindau Protein (pVHL) in Limb Bud Mesenchyme

午後しんどくなり二時間ほど昼寝をしました。というわけで午後は午後は二つしか聞いていません。
Dr.Koivunen: Hearts of Hypoxia-Inducible Factor Prolyl 4-Hydroxylase-2 Hypomorphic Mice Show Protection Against Ischemia-Reperfusion Injury

Dr. Miller: Hydrogen Sulfide Protects against Hypoxia in C. elegans

夕方のセッションはInflammation

Dr.Görlach: ROS and HIF Crosstalk

NOXの話しが中心

Dr. Colgan: The Interplay of Hypoxia and Mucosal Inflammation
Inflammation hypoxia

Inflammation hypoxiaの概念の説明

Dr. Taylor: Loss of Prolyl Hydroxylase-1 (PHD-1) is Protective in a Murine Model of Inflammatory Bowel Disease

PHDの NF-kBの制御

Dr. Bergers: Induces Influx of Intratumoral Bone Marrow Derived Cells to Drive Neovascularization

Dr. Cramer: Dual Role of HIF-1alpha in the Pathogenesis of Inflammation-Associated Cancer

夕食時の雑談でじぶんはただの分子生物学者に過ぎなかったということがよく解りました。

あと一日です。最後の観戦記は明日にはアップできません。

明後日は朝３時にKeystoneを立ちデンバーに向かいます。

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晴れです。

朝ごはんを会場で取っているとGLS氏が寄ってきました。前回は organizerだったので忙しそうでしたが今回は結構余裕な感じです。

朝のセッション

Cancerです。
初めの三つは腎癌
腎癌というのは特別な癌だということが実感できました。

Dr. Kaelin: Dioxygenases as Therapeutic Targets in Cancer

Dr. Maxwell: The HIF/PHD/VHLAxis in Kidney Cancer

この二つはかなり参考になりました。知識の整理もできたし。
Maxwell氏は驚くような結果を発表していましたがここには書きません。論文に出るとかそんなことを本人は言っていました。

Dr. Wright: Ror2 is a Non-Hypoxia HIF Target of VHL Inactivation in Renal Cell Carcinoma

Dr. Melillo: Targeting Hypoxic Cell Signaling for Cancer Therapy

はどこかで聞いたことのあるような話でした。

Dr. Schwab: HIF-1alpha Promotes Primary Tumor Growth, Lung Macrometastasis and Stem Cell Activity in the MMTV-PyMT Model of Luminal Breast Cancer

質疑応答はKaelin氏が保護者のように助けてあげていたのが印象的。

夕方から

Acute Responses to Hypoxia

Dr. Prabhakar: Acute Hypoxic Sensing and Reactive Oxygen Species

Dr. Garcia: ntersections of Stress-Responsive Signal Transduction Pathways

までは完全に followできたのですが以下ついていけませんでした。タイトルはsymposiaのページからどうぞ。

ゴンドラで山頂に行くはずがいけずその代わり、昼食後 N村さんと３時間くらい話したのですがこれが有意義でした。いろんなことが結構整理でき今回の収穫の一つですね。
ポスターは特に示唆的なものが一つありこれには考えさせられました。この話をヒントにうまく展開出来るとぼくらの研究もかなりのところまで行くかも …
いつも思いますがポスターセッションが盛り上がりますね。すごく偉い人がどんどん参加しています。日本の某学会も見習ったらどうかと思います。それでなければ学会などやめてしまえば。
これも意外と評判が良いので続けます。
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• Keystone Day 5-最終日
• Keystone Day 2
• Keystone 雑感-3
• Keystone 雑感-1

午前はBiology of Hypoxia Signalingで始まりました。

Johnson氏は欠席でスタートはHasse氏のPathophysiological Consequences of Chronic HIF Activation。

Carmeliet氏のGenetic Analyses of Prolyl Hydroxylases in Miceは面白かったです。動画を使いすぎの感もありましたけど。

次のRatcliffes氏はProtein Hydroxylation and the Signaling of Hypoxiaという題でHIF hydroxylaseの比較を系統的に行なっていました。FIH-1にもかなり時間をかけてました。

次のアルゼンチンからきたPerez-Perri氏は線虫のゲノム絡みの話なのですがかなり新鮮で興味が引かれました。
Oxygen-Regulated Degradation of Yeast SREBP by a Candidate Prolyl Hydroxylaseでお終いでした。これは今まで本気で考えたことがなかった話題でした。

お昼ごはんは近くのデリでバッファーローバーガー。

結局完食です。

お昼休みを挟んで午後はWorkshop 1: Graduate Students/PostDoc Symposium。

Linke氏のThe LL-Motif in HIF-alpha Contributes to FIH-1 Binding
が面白かったです。

このワークショップ８人の男女比が1:1でした。未来のhypoxistの世界は女性上位になるかも。
その後Pulmonary Responses to Hypoxiaのセッションでした。

人選とテーマが偏っていたのではないでしょうか。期待してたほどではありませんでしたが、肺高血圧におけるWnt-PPARgammaの関与の報告などは新鮮でした。
HIF-1, HIF-2というより HIF-1a, HIF-2aの使い分けは相変わらずよく取り上げられるテーマです。 今回は VHL関連は少ないような気がします。HIF hydroxylaseは両方共よく取り上げられます。

あっちは３つあるのですがこっちは一つなので FIH-1と皆が発言する度にすこし嬉しくなります。
夕方のセッションのあと研究室のD条先生の研究結果をGLSに見てもらいました。ずいぶん上がっていましたがなんとか結果は伝わったと思います。これはおもしろい話だと思いますので最後までやり遂げてください。

朝今ボストンいる N村さんに再開。懐かしかったです。

夜は、ナッシュビルにいる日本人の方に声をかけてもらいました。

こういう会では人と交流することが重要ですね。

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• カンテツ
• Keystone 雑感-1

疲れ果て眠りこける二人　放送で名前が呼ばれたのでたたき起こしました

Keystoneまでのシャトルの予約がめちゃくちゃになっていたのですが一緒の便の日本人研究者と無事乗車。二時間ほど真っ暗な田舎道を爆走すると急に廻りが白くなり道路は明らかに凍結していました。もう二時間遅ければシャトルを出してもらえなかったかも …

無事到着

この余波で冒頭のGLSのkeynote Addressを逃してしまいました。明日から真面目に出ます。関連するエントリー:

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• Keystone symposia, “Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways” #hypoxia
• Keystone Day 2
• がんばれよ・よーしきた

快晴、空港は暑い！！

同行の院生二人

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• Keystone Day 2

Keystone symposia, Hypoxia: Molecular Mechanisms of Oxygen Sensing and Response Pathways

一昨年に続き二回目で、今回は大学院生の二人の先生と三人で参加します。こういう学会に参加するのもこれで最後のような気がします。
とても楽しみです。アメリカに行くのは５年ぶりくらいです。どうなっているのかな特にネット事情
ミーティングの方は、前回同様、差支えのない範囲でレポートしようと思っています。

Natureに
Neuroscience: The most vulnerable brains
というエッセイが掲載されています。

An increase in premature births means that more babies are at risk of neurological damage. Erika Check Hayden talks with researchers who are developing ways to help these children.

という内容なのですがなかなかの美談です。

先日本屋で沢木耕太郎さんの右か、左かという本を見つけました。こんなのあったのあったのかとよく見てみると”心に残る物語 日本文学秀作選”と言う事で短編小説集でした。

あとがきに沢木氏本人の解説があったので買って読んでみました。
収録されているのは次の１３編です。

風薫るウィーンの旅六日間ー小川洋子

魔術ー芥川龍之介

黄金の腕ー阿佐田哲也

その木戸を通ってー山本周五郎

プールサイド小景ー庄野潤三

寝台の舟ー吉行淳之介

ロマネ・コンティー・1935年ー開高健

散る日本ー坂口安吾

ダウトー向田邦子

賽子無宿ー藤沢周平

人間椅子ー江戸川乱歩

天使が見たものー阿部昭

レーダーボーゼンー村上春樹

半分くらいは読んだことがあり残り半分は初めて読む小説でした。
村上春樹氏は短編でも尋常でない力を発揮します。何度か読み返していますが、好きなのは、神の子どもたちはみな踊る (新潮文庫)に入っている”タイランド”です。すばらしい短編だと思います。

職場からの眺めは最高です。夕方患者を帰宅させたあと一日の反省会を開くことがありますが、時間があうと比叡山、東山が夕陽に照らされて幻想的な光景が現れることがあります。

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